Protein–RNA interactions for Protein: P0DMP2

SRGAP2B, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP2BP0DMP2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SRGAP2BP0DMP2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SRGAP2BP0DMP2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SRGAP2BP0DMP2 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SRGAP2BP0DMP2 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SRGAP2BP0DMP2 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SRGAP2BP0DMP2 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SRGAP2BP0DMP2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SRGAP2BP0DMP2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SRGAP2BP0DMP2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SRGAP2BP0DMP2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SRGAP2BP0DMP2 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SRGAP2BP0DMP2 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SRGAP2BP0DMP2 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SRGAP2BP0DMP2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SRGAP2BP0DMP2 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SRGAP2BP0DMP2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SRGAP2BP0DMP2 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SRGAP2BP0DMP2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SRGAP2BP0DMP2 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SRGAP2BP0DMP2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SRGAP2BP0DMP2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SRGAP2BP0DMP2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SRGAP2BP0DMP2 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SRGAP2BP0DMP2 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SRGAP2BP0DMP2 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SRGAP2BP0DMP2 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SRGAP2BP0DMP2 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SRGAP2BP0DMP2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SRGAP2BP0DMP2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SRGAP2BP0DMP2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SRGAP2BP0DMP2 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SRGAP2BP0DMP2 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SRGAP2BP0DMP2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SRGAP2BP0DMP2 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SRGAP2BP0DMP2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SRGAP2BP0DMP2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SRGAP2BP0DMP2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SRGAP2BP0DMP2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SRGAP2BP0DMP2 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SRGAP2BP0DMP2 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SRGAP2BP0DMP2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SRGAP2BP0DMP2 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SRGAP2BP0DMP2 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SRGAP2BP0DMP2 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SRGAP2BP0DMP2 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SRGAP2BP0DMP2 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SRGAP2BP0DMP2 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SRGAP2BP0DMP2 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SRGAP2BP0DMP2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SRGAP2BP0DMP2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SRGAP2BP0DMP2 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SRGAP2BP0DMP2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SRGAP2BP0DMP2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SRGAP2BP0DMP2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SRGAP2BP0DMP2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SRGAP2BP0DMP2 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SRGAP2BP0DMP2 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SRGAP2BP0DMP2 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SRGAP2BP0DMP2 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SRGAP2BP0DMP2 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SRGAP2BP0DMP2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SRGAP2BP0DMP2 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SRGAP2BP0DMP2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SRGAP2BP0DMP2 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SRGAP2BP0DMP2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SRGAP2BP0DMP2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SRGAP2BP0DMP2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SRGAP2BP0DMP2 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SRGAP2BP0DMP2 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SRGAP2BP0DMP2 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SRGAP2BP0DMP2 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SRGAP2BP0DMP2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SRGAP2BP0DMP2 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SRGAP2BP0DMP2 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SRGAP2BP0DMP2 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SRGAP2BP0DMP2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SRGAP2BP0DMP2 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SRGAP2BP0DMP2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SRGAP2BP0DMP2 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SRGAP2BP0DMP2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SRGAP2BP0DMP2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SRGAP2BP0DMP2 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SRGAP2BP0DMP2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SRGAP2BP0DMP2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SRGAP2BP0DMP2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SRGAP2BP0DMP2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SRGAP2BP0DMP2 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SRGAP2BP0DMP2 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SRGAP2BP0DMP2 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SRGAP2BP0DMP2 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SRGAP2BP0DMP2 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SRGAP2BP0DMP2 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SRGAP2BP0DMP2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SRGAP2BP0DMP2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SRGAP2BP0DMP2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SRGAP2BP0DMP2 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SRGAP2BP0DMP2 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SRGAP2BP0DMP2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SRGAP2BP0DMP2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms