Protein–RNA interactions for Protein: P0C7H9

USP17L7, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L7P0C7H9 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP17L7P0C7H9 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP17L7P0C7H9 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP17L7P0C7H9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP17L7P0C7H9 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP17L7P0C7H9 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP17L7P0C7H9 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP17L7P0C7H9 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP17L7P0C7H9 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP17L7P0C7H9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP17L7P0C7H9 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP17L7P0C7H9 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP17L7P0C7H9 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP17L7P0C7H9 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP17L7P0C7H9 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP17L7P0C7H9 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP17L7P0C7H9 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP17L7P0C7H9 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP17L7P0C7H9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP17L7P0C7H9 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP17L7P0C7H9 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP17L7P0C7H9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP17L7P0C7H9 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP17L7P0C7H9 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP17L7P0C7H9 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
USP17L7P0C7H9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP17L7P0C7H9 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP17L7P0C7H9 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP17L7P0C7H9 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP17L7P0C7H9 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP17L7P0C7H9 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP17L7P0C7H9 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP17L7P0C7H9 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP17L7P0C7H9 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP17L7P0C7H9 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP17L7P0C7H9 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP17L7P0C7H9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP17L7P0C7H9 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP17L7P0C7H9 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP17L7P0C7H9 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP17L7P0C7H9 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP17L7P0C7H9 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP17L7P0C7H9 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
USP17L7P0C7H9 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP17L7P0C7H9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP17L7P0C7H9 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP17L7P0C7H9 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
USP17L7P0C7H9 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP17L7P0C7H9 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP17L7P0C7H9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP17L7P0C7H9 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP17L7P0C7H9 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP17L7P0C7H9 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP17L7P0C7H9 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP17L7P0C7H9 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP17L7P0C7H9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP17L7P0C7H9 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP17L7P0C7H9 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP17L7P0C7H9 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP17L7P0C7H9 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP17L7P0C7H9 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP17L7P0C7H9 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP17L7P0C7H9 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP17L7P0C7H9 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP17L7P0C7H9 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
USP17L7P0C7H9 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
USP17L7P0C7H9 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP17L7P0C7H9 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP17L7P0C7H9 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP17L7P0C7H9 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP17L7P0C7H9 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP17L7P0C7H9 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP17L7P0C7H9 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP17L7P0C7H9 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP17L7P0C7H9 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP17L7P0C7H9 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP17L7P0C7H9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP17L7P0C7H9 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP17L7P0C7H9 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
USP17L7P0C7H9 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
USP17L7P0C7H9 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP17L7P0C7H9 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP17L7P0C7H9 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP17L7P0C7H9 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP17L7P0C7H9 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP17L7P0C7H9 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP17L7P0C7H9 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP17L7P0C7H9 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP17L7P0C7H9 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP17L7P0C7H9 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
USP17L7P0C7H9 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP17L7P0C7H9 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
USP17L7P0C7H9 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP17L7P0C7H9 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP17L7P0C7H9 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP17L7P0C7H9 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP17L7P0C7H9 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP17L7P0C7H9 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP17L7P0C7H9 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP17L7P0C7H9 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.8 ms