Protein–RNA interactions for Protein: P09326

CD48, CD48 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD48P09326 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CD48P09326 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CD48P09326 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CD48P09326 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CD48P09326 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CD48P09326 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CD48P09326 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CD48P09326 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CD48P09326 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CD48P09326 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CD48P09326 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CD48P09326 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CD48P09326 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CD48P09326 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CD48P09326 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CD48P09326 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CD48P09326 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CD48P09326 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CD48P09326 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CD48P09326 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CD48P09326 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CD48P09326 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CD48P09326 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CD48P09326 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CD48P09326 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CD48P09326 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CD48P09326 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CD48P09326 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CD48P09326 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CD48P09326 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CD48P09326 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CD48P09326 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CD48P09326 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CD48P09326 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CD48P09326 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CD48P09326 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CD48P09326 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CD48P09326 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CD48P09326 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CD48P09326 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CD48P09326 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CD48P09326 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CD48P09326 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CD48P09326 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CD48P09326 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CD48P09326 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CD48P09326 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CD48P09326 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CD48P09326 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CD48P09326 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CD48P09326 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CD48P09326 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CD48P09326 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CD48P09326 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CD48P09326 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CD48P09326 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CD48P09326 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CD48P09326 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CD48P09326 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CD48P09326 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CD48P09326 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CD48P09326 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CD48P09326 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CD48P09326 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CD48P09326 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CD48P09326 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CD48P09326 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CD48P09326 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CD48P09326 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CD48P09326 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CD48P09326 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CD48P09326 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CD48P09326 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CD48P09326 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CD48P09326 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CD48P09326 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CD48P09326 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CD48P09326 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CD48P09326 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CD48P09326 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CD48P09326 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CD48P09326 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CD48P09326 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CD48P09326 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CD48P09326 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CD48P09326 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CD48P09326 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CD48P09326 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CD48P09326 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CD48P09326 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CD48P09326 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CD48P09326 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CD48P09326 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CD48P09326 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CD48P09326 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CD48P09326 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CD48P09326 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CD48P09326 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CD48P09326 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CD48P09326 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms