Protein–RNA interactions for Protein: P06727

APOA4, Apolipoprotein A-IV, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA4P06727 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
APOA4P06727 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
APOA4P06727 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
APOA4P06727 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
APOA4P06727 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
APOA4P06727 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
APOA4P06727 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
APOA4P06727 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
APOA4P06727 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
APOA4P06727 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
APOA4P06727 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
APOA4P06727 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
APOA4P06727 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
APOA4P06727 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
APOA4P06727 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
APOA4P06727 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
APOA4P06727 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
APOA4P06727 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
APOA4P06727 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
APOA4P06727 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
APOA4P06727 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
APOA4P06727 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
APOA4P06727 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
APOA4P06727 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
APOA4P06727 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
APOA4P06727 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
APOA4P06727 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
APOA4P06727 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
APOA4P06727 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
APOA4P06727 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
APOA4P06727 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
APOA4P06727 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
APOA4P06727 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
APOA4P06727 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
APOA4P06727 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
APOA4P06727 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
APOA4P06727 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
APOA4P06727 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
APOA4P06727 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
APOA4P06727 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
APOA4P06727 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
APOA4P06727 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
APOA4P06727 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
APOA4P06727 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
APOA4P06727 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
APOA4P06727 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
APOA4P06727 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
APOA4P06727 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
APOA4P06727 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
APOA4P06727 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
APOA4P06727 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
APOA4P06727 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
APOA4P06727 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
APOA4P06727 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
APOA4P06727 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
APOA4P06727 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
APOA4P06727 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
APOA4P06727 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
APOA4P06727 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
APOA4P06727 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
APOA4P06727 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
APOA4P06727 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
APOA4P06727 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
APOA4P06727 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
APOA4P06727 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
APOA4P06727 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
APOA4P06727 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
APOA4P06727 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
APOA4P06727 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
APOA4P06727 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
APOA4P06727 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
APOA4P06727 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
APOA4P06727 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
APOA4P06727 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
APOA4P06727 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
APOA4P06727 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
APOA4P06727 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
APOA4P06727 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
APOA4P06727 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
APOA4P06727 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
APOA4P06727 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
APOA4P06727 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
APOA4P06727 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
APOA4P06727 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
APOA4P06727 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
APOA4P06727 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
APOA4P06727 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
APOA4P06727 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
APOA4P06727 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
APOA4P06727 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
APOA4P06727 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
APOA4P06727 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
APOA4P06727 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
APOA4P06727 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
APOA4P06727 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
APOA4P06727 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
APOA4P06727 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
APOA4P06727 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
APOA4P06727 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
APOA4P06727 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms