Protein–RNA interactions for Protein: P05129

PRKCG, Protein kinase C gamma type, humanhuman

Predictions only

Length 697 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCGP05129 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRKCGP05129 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRKCGP05129 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRKCGP05129 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRKCGP05129 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRKCGP05129 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRKCGP05129 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRKCGP05129 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRKCGP05129 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRKCGP05129 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRKCGP05129 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRKCGP05129 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRKCGP05129 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRKCGP05129 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRKCGP05129 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PRKCGP05129 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRKCGP05129 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRKCGP05129 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRKCGP05129 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRKCGP05129 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PRKCGP05129 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PRKCGP05129 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRKCGP05129 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRKCGP05129 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRKCGP05129 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRKCGP05129 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRKCGP05129 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRKCGP05129 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRKCGP05129 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRKCGP05129 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRKCGP05129 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRKCGP05129 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRKCGP05129 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRKCGP05129 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRKCGP05129 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRKCGP05129 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRKCGP05129 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRKCGP05129 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRKCGP05129 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRKCGP05129 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRKCGP05129 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRKCGP05129 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRKCGP05129 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRKCGP05129 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRKCGP05129 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRKCGP05129 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PRKCGP05129 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRKCGP05129 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRKCGP05129 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRKCGP05129 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRKCGP05129 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRKCGP05129 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRKCGP05129 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRKCGP05129 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRKCGP05129 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRKCGP05129 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRKCGP05129 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRKCGP05129 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRKCGP05129 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRKCGP05129 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRKCGP05129 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRKCGP05129 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRKCGP05129 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRKCGP05129 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRKCGP05129 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRKCGP05129 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRKCGP05129 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRKCGP05129 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRKCGP05129 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRKCGP05129 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRKCGP05129 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRKCGP05129 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRKCGP05129 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRKCGP05129 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRKCGP05129 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRKCGP05129 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRKCGP05129 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRKCGP05129 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRKCGP05129 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRKCGP05129 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRKCGP05129 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PRKCGP05129 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PRKCGP05129 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PRKCGP05129 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PRKCGP05129 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PRKCGP05129 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRKCGP05129 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRKCGP05129 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRKCGP05129 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRKCGP05129 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRKCGP05129 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRKCGP05129 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRKCGP05129 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRKCGP05129 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PRKCGP05129 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PRKCGP05129 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRKCGP05129 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRKCGP05129 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRKCGP05129 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRKCGP05129 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms