Protein–RNA interactions for Protein: P02748

C9, Complement component C9, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9P02748 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C9P02748 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C9P02748 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
C9P02748 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
C9P02748 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
C9P02748 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
C9P02748 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
C9P02748 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
C9P02748 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
C9P02748 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C9P02748 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
C9P02748 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
C9P02748 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C9P02748 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
C9P02748 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C9P02748 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C9P02748 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C9P02748 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C9P02748 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C9P02748 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C9P02748 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C9P02748 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C9P02748 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C9P02748 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C9P02748 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C9P02748 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C9P02748 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C9P02748 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C9P02748 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C9P02748 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C9P02748 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C9P02748 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C9P02748 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
C9P02748 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C9P02748 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C9P02748 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C9P02748 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C9P02748 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C9P02748 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C9P02748 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C9P02748 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C9P02748 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C9P02748 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C9P02748 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C9P02748 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C9P02748 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C9P02748 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
C9P02748 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
C9P02748 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C9P02748 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C9P02748 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C9P02748 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C9P02748 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C9P02748 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C9P02748 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C9P02748 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C9P02748 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C9P02748 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
C9P02748 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
C9P02748 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
C9P02748 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
C9P02748 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C9P02748 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C9P02748 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C9P02748 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C9P02748 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C9P02748 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C9P02748 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C9P02748 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C9P02748 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C9P02748 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C9P02748 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C9P02748 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C9P02748 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C9P02748 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C9P02748 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C9P02748 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C9P02748 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C9P02748 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C9P02748 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C9P02748 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C9P02748 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C9P02748 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C9P02748 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C9P02748 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C9P02748 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C9P02748 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C9P02748 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C9P02748 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
C9P02748 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C9P02748 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C9P02748 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C9P02748 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C9P02748 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C9P02748 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C9P02748 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C9P02748 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C9P02748 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C9P02748 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C9P02748 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms