Protein–RNA interactions for Protein: P00966

ASS1, Argininosuccinate synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASS1P00966 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ASS1P00966 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ASS1P00966 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ASS1P00966 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ASS1P00966 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ASS1P00966 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ASS1P00966 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ASS1P00966 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ASS1P00966 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ASS1P00966 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ASS1P00966 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ASS1P00966 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ASS1P00966 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ASS1P00966 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
ASS1P00966 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ASS1P00966 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ASS1P00966 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ASS1P00966 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
ASS1P00966 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ASS1P00966 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ASS1P00966 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
ASS1P00966 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ASS1P00966 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ASS1P00966 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ASS1P00966 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ASS1P00966 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ASS1P00966 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ASS1P00966 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ASS1P00966 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ASS1P00966 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ASS1P00966 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ASS1P00966 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ASS1P00966 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ASS1P00966 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ASS1P00966 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ASS1P00966 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ASS1P00966 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ASS1P00966 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ASS1P00966 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ASS1P00966 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ASS1P00966 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ASS1P00966 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ASS1P00966 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
ASS1P00966 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ASS1P00966 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ASS1P00966 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ASS1P00966 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ASS1P00966 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ASS1P00966 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ASS1P00966 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ASS1P00966 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ASS1P00966 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ASS1P00966 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ASS1P00966 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ASS1P00966 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ASS1P00966 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ASS1P00966 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
ASS1P00966 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ASS1P00966 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ASS1P00966 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ASS1P00966 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ASS1P00966 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ASS1P00966 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ASS1P00966 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ASS1P00966 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ASS1P00966 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ASS1P00966 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ASS1P00966 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ASS1P00966 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ASS1P00966 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ASS1P00966 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ASS1P00966 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ASS1P00966 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ASS1P00966 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ASS1P00966 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ASS1P00966 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ASS1P00966 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ASS1P00966 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ASS1P00966 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ASS1P00966 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ASS1P00966 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ASS1P00966 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ASS1P00966 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ASS1P00966 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ASS1P00966 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ASS1P00966 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ASS1P00966 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ASS1P00966 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ASS1P00966 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ASS1P00966 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ASS1P00966 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ASS1P00966 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ASS1P00966 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ASS1P00966 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ASS1P00966 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ASS1P00966 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ASS1P00966 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ASS1P00966 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ASS1P00966 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ASS1P00966 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms