Protein–RNA interactions for Protein: O95202

LETM1, Mitochondrial proton/calcium exchanger protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETM1O95202 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LETM1O95202 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LETM1O95202 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LETM1O95202 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LETM1O95202 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LETM1O95202 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LETM1O95202 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LETM1O95202 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LETM1O95202 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LETM1O95202 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LETM1O95202 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LETM1O95202 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LETM1O95202 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LETM1O95202 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LETM1O95202 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LETM1O95202 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LETM1O95202 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LETM1O95202 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LETM1O95202 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LETM1O95202 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LETM1O95202 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
LETM1O95202 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
LETM1O95202 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
LETM1O95202 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
LETM1O95202 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
LETM1O95202 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
LETM1O95202 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.81
LETM1O95202 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
LETM1O95202 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LETM1O95202 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LETM1O95202 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LETM1O95202 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LETM1O95202 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LETM1O95202 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LETM1O95202 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LETM1O95202 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LETM1O95202 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LETM1O95202 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LETM1O95202 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LETM1O95202 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LETM1O95202 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LETM1O95202 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LETM1O95202 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LETM1O95202 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LETM1O95202 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LETM1O95202 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LETM1O95202 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LETM1O95202 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LETM1O95202 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LETM1O95202 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LETM1O95202 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LETM1O95202 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LETM1O95202 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LETM1O95202 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LETM1O95202 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LETM1O95202 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LETM1O95202 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LETM1O95202 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LETM1O95202 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LETM1O95202 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LETM1O95202 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LETM1O95202 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LETM1O95202 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LETM1O95202 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LETM1O95202 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LETM1O95202 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LETM1O95202 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LETM1O95202 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LETM1O95202 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LETM1O95202 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
LETM1O95202 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LETM1O95202 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LETM1O95202 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LETM1O95202 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LETM1O95202 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LETM1O95202 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
LETM1O95202 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LETM1O95202 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
LETM1O95202 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LETM1O95202 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
LETM1O95202 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LETM1O95202 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LETM1O95202 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
LETM1O95202 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
LETM1O95202 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LETM1O95202 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LETM1O95202 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LETM1O95202 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LETM1O95202 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LETM1O95202 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LETM1O95202 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
LETM1O95202 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LETM1O95202 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LETM1O95202 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LETM1O95202 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LETM1O95202 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LETM1O95202 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LETM1O95202 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LETM1O95202 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LETM1O95202 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms