Protein–RNA interactions for Protein: O76039

CDKL5, Cyclin-dependent kinase-like 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,030 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL5O76039 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CDKL5O76039 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CDKL5O76039 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CDKL5O76039 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CDKL5O76039 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDKL5O76039 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDKL5O76039 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDKL5O76039 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDKL5O76039 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDKL5O76039 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDKL5O76039 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CDKL5O76039 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CDKL5O76039 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CDKL5O76039 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CDKL5O76039 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CDKL5O76039 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CDKL5O76039 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CDKL5O76039 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CDKL5O76039 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
CDKL5O76039 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CDKL5O76039 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CDKL5O76039 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CDKL5O76039 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CDKL5O76039 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CDKL5O76039 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CDKL5O76039 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CDKL5O76039 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CDKL5O76039 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CDKL5O76039 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CDKL5O76039 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CDKL5O76039 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CDKL5O76039 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CDKL5O76039 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CDKL5O76039 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CDKL5O76039 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CDKL5O76039 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CDKL5O76039 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CDKL5O76039 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
CDKL5O76039 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CDKL5O76039 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CDKL5O76039 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CDKL5O76039 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CDKL5O76039 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CDKL5O76039 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CDKL5O76039 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
CDKL5O76039 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CDKL5O76039 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CDKL5O76039 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CDKL5O76039 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CDKL5O76039 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CDKL5O76039 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CDKL5O76039 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
CDKL5O76039 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CDKL5O76039 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CDKL5O76039 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CDKL5O76039 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CDKL5O76039 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CDKL5O76039 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CDKL5O76039 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CDKL5O76039 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CDKL5O76039 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CDKL5O76039 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CDKL5O76039 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
CDKL5O76039 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CDKL5O76039 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CDKL5O76039 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CDKL5O76039 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CDKL5O76039 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CDKL5O76039 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CDKL5O76039 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CDKL5O76039 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CDKL5O76039 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CDKL5O76039 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CDKL5O76039 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CDKL5O76039 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CDKL5O76039 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CDKL5O76039 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CDKL5O76039 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CDKL5O76039 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CDKL5O76039 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CDKL5O76039 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CDKL5O76039 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CDKL5O76039 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CDKL5O76039 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CDKL5O76039 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDKL5O76039 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDKL5O76039 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDKL5O76039 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDKL5O76039 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDKL5O76039 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDKL5O76039 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDKL5O76039 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDKL5O76039 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDKL5O76039 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDKL5O76039 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDKL5O76039 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDKL5O76039 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDKL5O76039 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
CDKL5O76039 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CDKL5O76039 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms