Protein–RNA interactions for Protein: O75575

CRCP, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC9, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRCPO75575 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRCPO75575 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRCPO75575 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRCPO75575 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRCPO75575 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRCPO75575 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRCPO75575 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRCPO75575 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRCPO75575 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRCPO75575 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRCPO75575 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRCPO75575 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRCPO75575 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRCPO75575 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CRCPO75575 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CRCPO75575 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CRCPO75575 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CRCPO75575 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CRCPO75575 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CRCPO75575 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CRCPO75575 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CRCPO75575 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CRCPO75575 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CRCPO75575 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CRCPO75575 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CRCPO75575 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CRCPO75575 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CRCPO75575 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRCPO75575 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRCPO75575 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRCPO75575 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRCPO75575 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CRCPO75575 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRCPO75575 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CRCPO75575 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRCPO75575 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRCPO75575 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRCPO75575 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRCPO75575 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRCPO75575 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRCPO75575 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRCPO75575 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CRCPO75575 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CRCPO75575 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CRCPO75575 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CRCPO75575 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CRCPO75575 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CRCPO75575 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CRCPO75575 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CRCPO75575 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CRCPO75575 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CRCPO75575 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CRCPO75575 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CRCPO75575 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CRCPO75575 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CRCPO75575 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CRCPO75575 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CRCPO75575 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CRCPO75575 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CRCPO75575 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CRCPO75575 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CRCPO75575 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CRCPO75575 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CRCPO75575 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CRCPO75575 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CRCPO75575 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CRCPO75575 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CRCPO75575 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CRCPO75575 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CRCPO75575 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CRCPO75575 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CRCPO75575 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CRCPO75575 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CRCPO75575 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CRCPO75575 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CRCPO75575 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CRCPO75575 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CRCPO75575 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CRCPO75575 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CRCPO75575 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CRCPO75575 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CRCPO75575 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CRCPO75575 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CRCPO75575 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CRCPO75575 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CRCPO75575 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CRCPO75575 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CRCPO75575 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CRCPO75575 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CRCPO75575 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CRCPO75575 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CRCPO75575 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CRCPO75575 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CRCPO75575 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CRCPO75575 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CRCPO75575 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CRCPO75575 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CRCPO75575 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CRCPO75575 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CRCPO75575 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.4 ms