Protein–RNA interactions for Protein: O75385

ULK1, Serine/threonine-protein kinase ULK1, humanhuman

Predictions only

Length 1,050 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ULK1O75385 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ULK1O75385 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ULK1O75385 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ULK1O75385 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ULK1O75385 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ULK1O75385 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ULK1O75385 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ULK1O75385 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ULK1O75385 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ULK1O75385 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ULK1O75385 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ULK1O75385 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ULK1O75385 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ULK1O75385 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ULK1O75385 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ULK1O75385 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ULK1O75385 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ULK1O75385 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ULK1O75385 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ULK1O75385 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ULK1O75385 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ULK1O75385 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ULK1O75385 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ULK1O75385 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ULK1O75385 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ULK1O75385 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ULK1O75385 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ULK1O75385 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ULK1O75385 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ULK1O75385 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ULK1O75385 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ULK1O75385 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ULK1O75385 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ULK1O75385 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ULK1O75385 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ULK1O75385 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ULK1O75385 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ULK1O75385 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ULK1O75385 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ULK1O75385 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ULK1O75385 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ULK1O75385 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ULK1O75385 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ULK1O75385 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ULK1O75385 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ULK1O75385 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ULK1O75385 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ULK1O75385 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ULK1O75385 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ULK1O75385 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ULK1O75385 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ULK1O75385 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ULK1O75385 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ULK1O75385 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ULK1O75385 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ULK1O75385 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ULK1O75385 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ULK1O75385 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ULK1O75385 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ULK1O75385 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ULK1O75385 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ULK1O75385 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ULK1O75385 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ULK1O75385 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ULK1O75385 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ULK1O75385 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ULK1O75385 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ULK1O75385 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ULK1O75385 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ULK1O75385 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ULK1O75385 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ULK1O75385 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ULK1O75385 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ULK1O75385 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ULK1O75385 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ULK1O75385 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ULK1O75385 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ULK1O75385 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ULK1O75385 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ULK1O75385 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ULK1O75385 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ULK1O75385 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ULK1O75385 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ULK1O75385 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ULK1O75385 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ULK1O75385 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ULK1O75385 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ULK1O75385 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ULK1O75385 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ULK1O75385 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ULK1O75385 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ULK1O75385 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ULK1O75385 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ULK1O75385 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ULK1O75385 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ULK1O75385 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ULK1O75385 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ULK1O75385 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ULK1O75385 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ULK1O75385 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms