Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PPFIA3O75145 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PPFIA3O75145 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PPFIA3O75145 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PPFIA3O75145 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PPFIA3O75145 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PPFIA3O75145 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PPFIA3O75145 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PPFIA3O75145 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PPFIA3O75145 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PPFIA3O75145 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PPFIA3O75145 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PPFIA3O75145 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PPFIA3O75145 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PPFIA3O75145 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PPFIA3O75145 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PPFIA3O75145 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PPFIA3O75145 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PPFIA3O75145 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PPFIA3O75145 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PPFIA3O75145 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PPFIA3O75145 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PPFIA3O75145 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PPFIA3O75145 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
PPFIA3O75145 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PPFIA3O75145 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PPFIA3O75145 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PPFIA3O75145 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PPFIA3O75145 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
PPFIA3O75145 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
PPFIA3O75145 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PPFIA3O75145 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
PPFIA3O75145 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PPFIA3O75145 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PPFIA3O75145 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PPFIA3O75145 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PPFIA3O75145 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PPFIA3O75145 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PPFIA3O75145 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PPFIA3O75145 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PPFIA3O75145 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PPFIA3O75145 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PPFIA3O75145 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PPFIA3O75145 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PPFIA3O75145 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PPFIA3O75145 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PPFIA3O75145 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PPFIA3O75145 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PPFIA3O75145 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PPFIA3O75145 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PPFIA3O75145 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PPFIA3O75145 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PPFIA3O75145 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PPFIA3O75145 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PPFIA3O75145 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PPFIA3O75145 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PPFIA3O75145 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PPFIA3O75145 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PPFIA3O75145 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PPFIA3O75145 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PPFIA3O75145 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
PPFIA3O75145 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PPFIA3O75145 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PPFIA3O75145 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PPFIA3O75145 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PPFIA3O75145 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PPFIA3O75145 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
PPFIA3O75145 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PPFIA3O75145 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PPFIA3O75145 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PPFIA3O75145 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PPFIA3O75145 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PPFIA3O75145 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
PPFIA3O75145 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PPFIA3O75145 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PPFIA3O75145 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PPFIA3O75145 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PPFIA3O75145 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PPFIA3O75145 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PPFIA3O75145 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PPFIA3O75145 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PPFIA3O75145 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PPFIA3O75145 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PPFIA3O75145 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PPFIA3O75145 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PPFIA3O75145 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PPFIA3O75145 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PPFIA3O75145 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PPFIA3O75145 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PPFIA3O75145 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PPFIA3O75145 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PPFIA3O75145 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PPFIA3O75145 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PPFIA3O75145 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PPFIA3O75145 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
PPFIA3O75145 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PPFIA3O75145 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
PPFIA3O75145 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
PPFIA3O75145 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PPFIA3O75145 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms