Protein–RNA interactions for Protein: O60826

CCDC22, Coiled-coil domain-containing protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC22O60826 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC22O60826 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC22O60826 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC22O60826 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC22O60826 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC22O60826 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC22O60826 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC22O60826 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC22O60826 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC22O60826 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC22O60826 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC22O60826 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC22O60826 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC22O60826 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC22O60826 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC22O60826 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC22O60826 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC22O60826 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC22O60826 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC22O60826 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC22O60826 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC22O60826 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC22O60826 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC22O60826 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC22O60826 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC22O60826 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC22O60826 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC22O60826 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC22O60826 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC22O60826 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC22O60826 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC22O60826 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC22O60826 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC22O60826 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC22O60826 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC22O60826 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC22O60826 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC22O60826 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC22O60826 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC22O60826 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC22O60826 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC22O60826 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC22O60826 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC22O60826 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC22O60826 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC22O60826 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC22O60826 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC22O60826 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC22O60826 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC22O60826 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC22O60826 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC22O60826 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC22O60826 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC22O60826 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC22O60826 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC22O60826 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC22O60826 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC22O60826 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC22O60826 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC22O60826 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC22O60826 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC22O60826 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC22O60826 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC22O60826 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC22O60826 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC22O60826 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC22O60826 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC22O60826 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC22O60826 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC22O60826 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC22O60826 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC22O60826 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC22O60826 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC22O60826 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC22O60826 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC22O60826 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC22O60826 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC22O60826 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC22O60826 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC22O60826 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC22O60826 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC22O60826 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC22O60826 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC22O60826 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC22O60826 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC22O60826 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC22O60826 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC22O60826 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC22O60826 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC22O60826 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC22O60826 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC22O60826 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC22O60826 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC22O60826 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC22O60826 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC22O60826 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC22O60826 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC22O60826 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC22O60826 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC22O60826 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms