Protein–RNA interactions for Protein: O60809

PRAMEF10, PRAME family member 10, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF10O60809 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PRAMEF10O60809 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PRAMEF10O60809 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PRAMEF10O60809 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PRAMEF10O60809 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PRAMEF10O60809 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRAMEF10O60809 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRAMEF10O60809 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRAMEF10O60809 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRAMEF10O60809 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRAMEF10O60809 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRAMEF10O60809 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRAMEF10O60809 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRAMEF10O60809 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRAMEF10O60809 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRAMEF10O60809 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRAMEF10O60809 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRAMEF10O60809 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRAMEF10O60809 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRAMEF10O60809 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRAMEF10O60809 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRAMEF10O60809 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRAMEF10O60809 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRAMEF10O60809 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRAMEF10O60809 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRAMEF10O60809 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRAMEF10O60809 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRAMEF10O60809 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRAMEF10O60809 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRAMEF10O60809 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRAMEF10O60809 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PRAMEF10O60809 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PRAMEF10O60809 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRAMEF10O60809 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRAMEF10O60809 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRAMEF10O60809 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRAMEF10O60809 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRAMEF10O60809 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRAMEF10O60809 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRAMEF10O60809 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRAMEF10O60809 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRAMEF10O60809 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRAMEF10O60809 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRAMEF10O60809 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRAMEF10O60809 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRAMEF10O60809 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRAMEF10O60809 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRAMEF10O60809 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRAMEF10O60809 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRAMEF10O60809 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRAMEF10O60809 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRAMEF10O60809 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRAMEF10O60809 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRAMEF10O60809 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRAMEF10O60809 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PRAMEF10O60809 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRAMEF10O60809 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRAMEF10O60809 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRAMEF10O60809 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRAMEF10O60809 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRAMEF10O60809 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRAMEF10O60809 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PRAMEF10O60809 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRAMEF10O60809 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRAMEF10O60809 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRAMEF10O60809 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRAMEF10O60809 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRAMEF10O60809 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRAMEF10O60809 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRAMEF10O60809 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRAMEF10O60809 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PRAMEF10O60809 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRAMEF10O60809 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRAMEF10O60809 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRAMEF10O60809 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRAMEF10O60809 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRAMEF10O60809 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRAMEF10O60809 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRAMEF10O60809 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRAMEF10O60809 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PRAMEF10O60809 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRAMEF10O60809 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRAMEF10O60809 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PRAMEF10O60809 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRAMEF10O60809 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PRAMEF10O60809 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRAMEF10O60809 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRAMEF10O60809 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRAMEF10O60809 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRAMEF10O60809 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRAMEF10O60809 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRAMEF10O60809 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRAMEF10O60809 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRAMEF10O60809 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRAMEF10O60809 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRAMEF10O60809 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRAMEF10O60809 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRAMEF10O60809 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRAMEF10O60809 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRAMEF10O60809 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
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