Protein–RNA interactions for Protein: O60636

TSPAN2, Tetraspanin-2, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN2O60636 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSPAN2O60636 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSPAN2O60636 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSPAN2O60636 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSPAN2O60636 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSPAN2O60636 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSPAN2O60636 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TSPAN2O60636 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSPAN2O60636 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSPAN2O60636 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSPAN2O60636 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSPAN2O60636 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSPAN2O60636 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSPAN2O60636 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSPAN2O60636 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TSPAN2O60636 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TSPAN2O60636 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TSPAN2O60636 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TSPAN2O60636 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TSPAN2O60636 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TSPAN2O60636 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TSPAN2O60636 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TSPAN2O60636 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TSPAN2O60636 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
TSPAN2O60636 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
TSPAN2O60636 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TSPAN2O60636 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TSPAN2O60636 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TSPAN2O60636 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TSPAN2O60636 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TSPAN2O60636 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TSPAN2O60636 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TSPAN2O60636 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TSPAN2O60636 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TSPAN2O60636 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TSPAN2O60636 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TSPAN2O60636 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TSPAN2O60636 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TSPAN2O60636 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TSPAN2O60636 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TSPAN2O60636 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TSPAN2O60636 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TSPAN2O60636 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TSPAN2O60636 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TSPAN2O60636 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TSPAN2O60636 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TSPAN2O60636 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TSPAN2O60636 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TSPAN2O60636 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TSPAN2O60636 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TSPAN2O60636 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TSPAN2O60636 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TSPAN2O60636 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TSPAN2O60636 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TSPAN2O60636 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TSPAN2O60636 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TSPAN2O60636 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TSPAN2O60636 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TSPAN2O60636 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TSPAN2O60636 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TSPAN2O60636 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TSPAN2O60636 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TSPAN2O60636 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TSPAN2O60636 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TSPAN2O60636 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TSPAN2O60636 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TSPAN2O60636 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TSPAN2O60636 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TSPAN2O60636 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TSPAN2O60636 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TSPAN2O60636 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TSPAN2O60636 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TSPAN2O60636 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TSPAN2O60636 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TSPAN2O60636 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TSPAN2O60636 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TSPAN2O60636 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TSPAN2O60636 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TSPAN2O60636 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TSPAN2O60636 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TSPAN2O60636 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TSPAN2O60636 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TSPAN2O60636 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TSPAN2O60636 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TSPAN2O60636 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TSPAN2O60636 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TSPAN2O60636 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TSPAN2O60636 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TSPAN2O60636 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TSPAN2O60636 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TSPAN2O60636 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TSPAN2O60636 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TSPAN2O60636 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TSPAN2O60636 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TSPAN2O60636 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TSPAN2O60636 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TSPAN2O60636 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TSPAN2O60636 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TSPAN2O60636 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TSPAN2O60636 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 194.9 ms