Protein–RNA interactions for Protein: O43933

PEX1, Peroxisome biogenesis factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX1O43933 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PEX1O43933 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PEX1O43933 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PEX1O43933 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PEX1O43933 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PEX1O43933 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PEX1O43933 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PEX1O43933 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PEX1O43933 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PEX1O43933 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PEX1O43933 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PEX1O43933 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PEX1O43933 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PEX1O43933 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PEX1O43933 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PEX1O43933 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PEX1O43933 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PEX1O43933 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PEX1O43933 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PEX1O43933 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PEX1O43933 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PEX1O43933 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PEX1O43933 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PEX1O43933 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PEX1O43933 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PEX1O43933 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PEX1O43933 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PEX1O43933 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PEX1O43933 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PEX1O43933 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PEX1O43933 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PEX1O43933 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PEX1O43933 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PEX1O43933 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PEX1O43933 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PEX1O43933 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PEX1O43933 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PEX1O43933 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PEX1O43933 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PEX1O43933 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PEX1O43933 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PEX1O43933 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PEX1O43933 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PEX1O43933 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PEX1O43933 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PEX1O43933 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PEX1O43933 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PEX1O43933 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PEX1O43933 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PEX1O43933 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PEX1O43933 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PEX1O43933 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PEX1O43933 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PEX1O43933 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PEX1O43933 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PEX1O43933 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PEX1O43933 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PEX1O43933 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PEX1O43933 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PEX1O43933 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PEX1O43933 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PEX1O43933 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PEX1O43933 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PEX1O43933 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PEX1O43933 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PEX1O43933 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PEX1O43933 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PEX1O43933 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PEX1O43933 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PEX1O43933 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PEX1O43933 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PEX1O43933 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PEX1O43933 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PEX1O43933 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PEX1O43933 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PEX1O43933 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PEX1O43933 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PEX1O43933 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PEX1O43933 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PEX1O43933 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PEX1O43933 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PEX1O43933 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PEX1O43933 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PEX1O43933 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PEX1O43933 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PEX1O43933 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PEX1O43933 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PEX1O43933 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PEX1O43933 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PEX1O43933 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PEX1O43933 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PEX1O43933 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PEX1O43933 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PEX1O43933 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PEX1O43933 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PEX1O43933 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PEX1O43933 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PEX1O43933 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PEX1O43933 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PEX1O43933 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms