Protein–RNA interactions for Protein: O43435

TBX1, T-box transcription factor TBX1, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBX1O43435 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TBX1O43435 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TBX1O43435 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TBX1O43435 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TBX1O43435 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TBX1O43435 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TBX1O43435 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TBX1O43435 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
TBX1O43435 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TBX1O43435 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TBX1O43435 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TBX1O43435 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TBX1O43435 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TBX1O43435 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TBX1O43435 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TBX1O43435 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TBX1O43435 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TBX1O43435 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TBX1O43435 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TBX1O43435 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TBX1O43435 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TBX1O43435 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
TBX1O43435 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TBX1O43435 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TBX1O43435 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TBX1O43435 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TBX1O43435 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TBX1O43435 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TBX1O43435 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TBX1O43435 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TBX1O43435 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TBX1O43435 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
TBX1O43435 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TBX1O43435 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TBX1O43435 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TBX1O43435 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TBX1O43435 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
TBX1O43435 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TBX1O43435 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TBX1O43435 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TBX1O43435 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TBX1O43435 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TBX1O43435 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TBX1O43435 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
TBX1O43435 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TBX1O43435 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TBX1O43435 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TBX1O43435 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
TBX1O43435 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TBX1O43435 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TBX1O43435 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TBX1O43435 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TBX1O43435 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TBX1O43435 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TBX1O43435 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TBX1O43435 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TBX1O43435 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TBX1O43435 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TBX1O43435 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TBX1O43435 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TBX1O43435 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TBX1O43435 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TBX1O43435 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TBX1O43435 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TBX1O43435 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TBX1O43435 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TBX1O43435 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TBX1O43435 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
TBX1O43435 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TBX1O43435 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TBX1O43435 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TBX1O43435 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TBX1O43435 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TBX1O43435 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TBX1O43435 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TBX1O43435 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TBX1O43435 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TBX1O43435 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TBX1O43435 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TBX1O43435 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
TBX1O43435 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
TBX1O43435 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TBX1O43435 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TBX1O43435 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TBX1O43435 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TBX1O43435 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TBX1O43435 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TBX1O43435 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TBX1O43435 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TBX1O43435 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TBX1O43435 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TBX1O43435 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TBX1O43435 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TBX1O43435 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TBX1O43435 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TBX1O43435 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TBX1O43435 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TBX1O43435 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TBX1O43435 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TBX1O43435 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.3 ms