Protein–RNA interactions for Protein: O43414

ERI3, ERI1 exoribonuclease 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERI3O43414 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERI3O43414 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ERI3O43414 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERI3O43414 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERI3O43414 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERI3O43414 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERI3O43414 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERI3O43414 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERI3O43414 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERI3O43414 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ERI3O43414 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERI3O43414 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERI3O43414 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERI3O43414 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ERI3O43414 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERI3O43414 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ERI3O43414 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERI3O43414 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERI3O43414 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ERI3O43414 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERI3O43414 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERI3O43414 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERI3O43414 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERI3O43414 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERI3O43414 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERI3O43414 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERI3O43414 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERI3O43414 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERI3O43414 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERI3O43414 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERI3O43414 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERI3O43414 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERI3O43414 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERI3O43414 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERI3O43414 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERI3O43414 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERI3O43414 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERI3O43414 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERI3O43414 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERI3O43414 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERI3O43414 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERI3O43414 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERI3O43414 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERI3O43414 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERI3O43414 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERI3O43414 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERI3O43414 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERI3O43414 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERI3O43414 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERI3O43414 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ERI3O43414 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ERI3O43414 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ERI3O43414 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ERI3O43414 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ERI3O43414 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERI3O43414 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERI3O43414 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERI3O43414 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERI3O43414 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERI3O43414 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERI3O43414 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERI3O43414 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERI3O43414 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERI3O43414 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERI3O43414 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERI3O43414 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERI3O43414 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERI3O43414 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERI3O43414 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERI3O43414 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERI3O43414 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERI3O43414 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERI3O43414 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERI3O43414 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERI3O43414 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERI3O43414 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERI3O43414 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERI3O43414 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERI3O43414 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERI3O43414 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERI3O43414 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERI3O43414 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERI3O43414 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERI3O43414 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ERI3O43414 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERI3O43414 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERI3O43414 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERI3O43414 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERI3O43414 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERI3O43414 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERI3O43414 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERI3O43414 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERI3O43414 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERI3O43414 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ERI3O43414 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERI3O43414 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERI3O43414 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ERI3O43414 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERI3O43414 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERI3O43414 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms