Protein–RNA interactions for Protein: O15068

MCF2L, Guanine nucleotide exchange factor DBS, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCF2LO15068 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
MCF2LO15068 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MCF2LO15068 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MCF2LO15068 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MCF2LO15068 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
MCF2LO15068 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MCF2LO15068 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MCF2LO15068 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MCF2LO15068 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MCF2LO15068 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MCF2LO15068 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MCF2LO15068 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MCF2LO15068 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MCF2LO15068 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
MCF2LO15068 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MCF2LO15068 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MCF2LO15068 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
MCF2LO15068 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MCF2LO15068 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MCF2LO15068 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MCF2LO15068 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MCF2LO15068 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MCF2LO15068 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MCF2LO15068 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MCF2LO15068 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MCF2LO15068 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MCF2LO15068 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MCF2LO15068 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MCF2LO15068 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MCF2LO15068 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MCF2LO15068 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MCF2LO15068 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MCF2LO15068 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MCF2LO15068 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MCF2LO15068 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MCF2LO15068 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MCF2LO15068 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MCF2LO15068 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
MCF2LO15068 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MCF2LO15068 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MCF2LO15068 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MCF2LO15068 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MCF2LO15068 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MCF2LO15068 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
MCF2LO15068 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MCF2LO15068 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MCF2LO15068 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MCF2LO15068 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MCF2LO15068 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MCF2LO15068 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MCF2LO15068 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MCF2LO15068 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MCF2LO15068 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MCF2LO15068 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MCF2LO15068 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MCF2LO15068 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
MCF2LO15068 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
MCF2LO15068 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MCF2LO15068 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MCF2LO15068 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MCF2LO15068 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MCF2LO15068 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MCF2LO15068 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
MCF2LO15068 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MCF2LO15068 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MCF2LO15068 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MCF2LO15068 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MCF2LO15068 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MCF2LO15068 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MCF2LO15068 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MCF2LO15068 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MCF2LO15068 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MCF2LO15068 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
MCF2LO15068 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MCF2LO15068 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MCF2LO15068 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MCF2LO15068 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MCF2LO15068 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MCF2LO15068 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MCF2LO15068 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MCF2LO15068 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MCF2LO15068 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MCF2LO15068 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MCF2LO15068 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MCF2LO15068 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MCF2LO15068 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MCF2LO15068 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MCF2LO15068 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MCF2LO15068 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MCF2LO15068 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MCF2LO15068 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MCF2LO15068 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MCF2LO15068 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MCF2LO15068 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MCF2LO15068 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MCF2LO15068 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MCF2LO15068 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MCF2LO15068 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MCF2LO15068 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MCF2LO15068 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms