Protein–RNA interactions for Protein: O15016

TRIM66, Tripartite motif-containing protein 66, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM66O15016 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM66O15016 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM66O15016 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM66O15016 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM66O15016 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM66O15016 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM66O15016 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM66O15016 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM66O15016 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM66O15016 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM66O15016 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM66O15016 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM66O15016 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM66O15016 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM66O15016 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TRIM66O15016 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM66O15016 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM66O15016 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM66O15016 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM66O15016 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM66O15016 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM66O15016 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM66O15016 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM66O15016 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM66O15016 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM66O15016 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM66O15016 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM66O15016 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM66O15016 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM66O15016 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM66O15016 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM66O15016 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM66O15016 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM66O15016 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM66O15016 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM66O15016 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM66O15016 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM66O15016 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM66O15016 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM66O15016 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM66O15016 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM66O15016 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM66O15016 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM66O15016 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM66O15016 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM66O15016 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM66O15016 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM66O15016 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM66O15016 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM66O15016 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TRIM66O15016 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM66O15016 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM66O15016 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM66O15016 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM66O15016 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM66O15016 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM66O15016 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM66O15016 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM66O15016 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM66O15016 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM66O15016 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM66O15016 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM66O15016 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM66O15016 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM66O15016 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM66O15016 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM66O15016 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM66O15016 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM66O15016 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM66O15016 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM66O15016 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM66O15016 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM66O15016 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM66O15016 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM66O15016 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM66O15016 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM66O15016 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM66O15016 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM66O15016 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM66O15016 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM66O15016 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM66O15016 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM66O15016 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM66O15016 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM66O15016 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM66O15016 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM66O15016 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM66O15016 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM66O15016 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM66O15016 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM66O15016 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM66O15016 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM66O15016 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM66O15016 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM66O15016 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM66O15016 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM66O15016 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM66O15016 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM66O15016 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM66O15016 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms