Protein–RNA interactions for Protein: O14815

CAPN9, Calpain-9, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN9O14815 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAPN9O14815 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAPN9O14815 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CAPN9O14815 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAPN9O14815 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAPN9O14815 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAPN9O14815 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAPN9O14815 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAPN9O14815 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAPN9O14815 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAPN9O14815 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAPN9O14815 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CAPN9O14815 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CAPN9O14815 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAPN9O14815 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAPN9O14815 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAPN9O14815 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAPN9O14815 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAPN9O14815 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAPN9O14815 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAPN9O14815 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAPN9O14815 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAPN9O14815 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CAPN9O14815 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CAPN9O14815 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CAPN9O14815 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CAPN9O14815 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CAPN9O14815 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CAPN9O14815 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CAPN9O14815 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CAPN9O14815 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CAPN9O14815 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CAPN9O14815 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CAPN9O14815 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CAPN9O14815 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CAPN9O14815 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CAPN9O14815 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAPN9O14815 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAPN9O14815 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAPN9O14815 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAPN9O14815 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAPN9O14815 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAPN9O14815 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAPN9O14815 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAPN9O14815 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAPN9O14815 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAPN9O14815 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAPN9O14815 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAPN9O14815 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAPN9O14815 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAPN9O14815 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAPN9O14815 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAPN9O14815 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAPN9O14815 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAPN9O14815 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAPN9O14815 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAPN9O14815 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAPN9O14815 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAPN9O14815 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAPN9O14815 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAPN9O14815 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAPN9O14815 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAPN9O14815 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPN9O14815 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPN9O14815 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPN9O14815 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPN9O14815 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPN9O14815 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPN9O14815 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAPN9O14815 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAPN9O14815 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAPN9O14815 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAPN9O14815 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAPN9O14815 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAPN9O14815 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAPN9O14815 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAPN9O14815 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CAPN9O14815 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CAPN9O14815 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CAPN9O14815 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CAPN9O14815 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CAPN9O14815 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CAPN9O14815 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAPN9O14815 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAPN9O14815 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAPN9O14815 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAPN9O14815 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CAPN9O14815 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAPN9O14815 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAPN9O14815 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAPN9O14815 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAPN9O14815 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAPN9O14815 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAPN9O14815 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAPN9O14815 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CAPN9O14815 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAPN9O14815 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAPN9O14815 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CAPN9O14815 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAPN9O14815 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.8 ms