Protein–RNA interactions for Protein: O14777

NDC80, Kinetochore protein NDC80 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDC80O14777 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NDC80O14777 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NDC80O14777 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NDC80O14777 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NDC80O14777 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NDC80O14777 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NDC80O14777 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NDC80O14777 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NDC80O14777 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NDC80O14777 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NDC80O14777 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NDC80O14777 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NDC80O14777 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NDC80O14777 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NDC80O14777 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NDC80O14777 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NDC80O14777 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NDC80O14777 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NDC80O14777 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NDC80O14777 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NDC80O14777 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NDC80O14777 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NDC80O14777 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NDC80O14777 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NDC80O14777 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NDC80O14777 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NDC80O14777 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NDC80O14777 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NDC80O14777 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NDC80O14777 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NDC80O14777 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
NDC80O14777 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
NDC80O14777 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NDC80O14777 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NDC80O14777 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NDC80O14777 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NDC80O14777 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NDC80O14777 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NDC80O14777 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NDC80O14777 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NDC80O14777 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NDC80O14777 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NDC80O14777 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NDC80O14777 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NDC80O14777 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NDC80O14777 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NDC80O14777 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NDC80O14777 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
NDC80O14777 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NDC80O14777 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NDC80O14777 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NDC80O14777 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NDC80O14777 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NDC80O14777 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NDC80O14777 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NDC80O14777 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NDC80O14777 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NDC80O14777 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NDC80O14777 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NDC80O14777 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NDC80O14777 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NDC80O14777 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
NDC80O14777 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NDC80O14777 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NDC80O14777 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NDC80O14777 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NDC80O14777 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NDC80O14777 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NDC80O14777 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NDC80O14777 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NDC80O14777 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NDC80O14777 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NDC80O14777 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NDC80O14777 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NDC80O14777 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NDC80O14777 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NDC80O14777 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NDC80O14777 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NDC80O14777 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NDC80O14777 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NDC80O14777 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NDC80O14777 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NDC80O14777 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NDC80O14777 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NDC80O14777 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NDC80O14777 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NDC80O14777 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NDC80O14777 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NDC80O14777 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NDC80O14777 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NDC80O14777 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NDC80O14777 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
NDC80O14777 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NDC80O14777 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NDC80O14777 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NDC80O14777 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NDC80O14777 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NDC80O14777 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NDC80O14777 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NDC80O14777 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms