Protein–RNA interactions for Protein: O00124

UBXN8, UBX domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8O00124 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBXN8O00124 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBXN8O00124 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBXN8O00124 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBXN8O00124 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBXN8O00124 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBXN8O00124 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBXN8O00124 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBXN8O00124 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBXN8O00124 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBXN8O00124 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBXN8O00124 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBXN8O00124 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
UBXN8O00124 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBXN8O00124 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBXN8O00124 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBXN8O00124 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBXN8O00124 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBXN8O00124 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBXN8O00124 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBXN8O00124 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBXN8O00124 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBXN8O00124 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
UBXN8O00124 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBXN8O00124 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBXN8O00124 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBXN8O00124 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBXN8O00124 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBXN8O00124 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBXN8O00124 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBXN8O00124 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBXN8O00124 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBXN8O00124 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBXN8O00124 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBXN8O00124 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBXN8O00124 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBXN8O00124 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
UBXN8O00124 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
UBXN8O00124 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
UBXN8O00124 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBXN8O00124 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBXN8O00124 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBXN8O00124 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBXN8O00124 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBXN8O00124 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBXN8O00124 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBXN8O00124 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UBXN8O00124 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBXN8O00124 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBXN8O00124 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBXN8O00124 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBXN8O00124 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBXN8O00124 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBXN8O00124 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBXN8O00124 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBXN8O00124 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBXN8O00124 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBXN8O00124 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UBXN8O00124 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBXN8O00124 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBXN8O00124 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBXN8O00124 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBXN8O00124 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBXN8O00124 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBXN8O00124 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBXN8O00124 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBXN8O00124 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UBXN8O00124 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBXN8O00124 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBXN8O00124 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBXN8O00124 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBXN8O00124 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBXN8O00124 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBXN8O00124 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBXN8O00124 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
UBXN8O00124 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBXN8O00124 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBXN8O00124 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBXN8O00124 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
UBXN8O00124 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBXN8O00124 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBXN8O00124 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBXN8O00124 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBXN8O00124 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBXN8O00124 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBXN8O00124 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBXN8O00124 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBXN8O00124 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
UBXN8O00124 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
UBXN8O00124 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBXN8O00124 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBXN8O00124 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBXN8O00124 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBXN8O00124 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBXN8O00124 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBXN8O00124 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBXN8O00124 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBXN8O00124 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBXN8O00124 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
UBXN8O00124 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.4 ms