Protein–RNA interactions for Protein: J3QLW9

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QLW9 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
J3QLW9 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
J3QLW9 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
J3QLW9 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
J3QLW9 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
J3QLW9 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
J3QLW9 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
J3QLW9 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
J3QLW9 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
J3QLW9 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
J3QLW9 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
J3QLW9 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
J3QLW9 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
J3QLW9 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
J3QLW9 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
J3QLW9 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
J3QLW9 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
J3QLW9 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
J3QLW9 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
J3QLW9 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
J3QLW9 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
J3QLW9 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
J3QLW9 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
J3QLW9 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
J3QLW9 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
J3QLW9 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
J3QLW9 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
J3QLW9 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
J3QLW9 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
J3QLW9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
J3QLW9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
J3QLW9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
J3QLW9 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
J3QLW9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
J3QLW9 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
J3QLW9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
J3QLW9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
J3QLW9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
J3QLW9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
J3QLW9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
J3QLW9 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
J3QLW9 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
J3QLW9 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
J3QLW9 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
J3QLW9 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
J3QLW9 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
J3QLW9 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
J3QLW9 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
J3QLW9 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
J3QLW9 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
J3QLW9 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
J3QLW9 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
J3QLW9 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
J3QLW9 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
J3QLW9 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
J3QLW9 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
J3QLW9 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
J3QLW9 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
J3QLW9 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
J3QLW9 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
J3QLW9 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
J3QLW9 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
J3QLW9 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
J3QLW9 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
J3QLW9 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
J3QLW9 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
J3QLW9 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
J3QLW9 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
J3QLW9 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
J3QLW9 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
J3QLW9 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
J3QLW9 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
J3QLW9 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
J3QLW9 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
J3QLW9 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
J3QLW9 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
J3QLW9 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
J3QLW9 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
J3QLW9 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
J3QLW9 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
J3QLW9 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
J3QLW9 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
J3QLW9 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
J3QLW9 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
J3QLW9 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
J3QLW9 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
J3QLW9 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
J3QLW9 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
J3QLW9 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
J3QLW9 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
J3QLW9 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
J3QLW9 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
J3QLW9 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
J3QLW9 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
J3QLW9 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
J3QLW9 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
J3QLW9 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
J3QLW9 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
J3QLW9 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
J3QLW9 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.1 ms