Protein–RNA interactions for Protein: H3BU86

STX16-NPEPL1, STX16-NPEPL1 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX16-NPEPL1H3BU86 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
STX16-NPEPL1H3BU86 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
STX16-NPEPL1H3BU86 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
STX16-NPEPL1H3BU86 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
STX16-NPEPL1H3BU86 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
STX16-NPEPL1H3BU86 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
STX16-NPEPL1H3BU86 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
STX16-NPEPL1H3BU86 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
STX16-NPEPL1H3BU86 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
STX16-NPEPL1H3BU86 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
STX16-NPEPL1H3BU86 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
STX16-NPEPL1H3BU86 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
STX16-NPEPL1H3BU86 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
STX16-NPEPL1H3BU86 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
STX16-NPEPL1H3BU86 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
STX16-NPEPL1H3BU86 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
STX16-NPEPL1H3BU86 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
STX16-NPEPL1H3BU86 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
STX16-NPEPL1H3BU86 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
STX16-NPEPL1H3BU86 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
STX16-NPEPL1H3BU86 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
STX16-NPEPL1H3BU86 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
STX16-NPEPL1H3BU86 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
STX16-NPEPL1H3BU86 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
STX16-NPEPL1H3BU86 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
STX16-NPEPL1H3BU86 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
STX16-NPEPL1H3BU86 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
STX16-NPEPL1H3BU86 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
STX16-NPEPL1H3BU86 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
STX16-NPEPL1H3BU86 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
STX16-NPEPL1H3BU86 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
STX16-NPEPL1H3BU86 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
STX16-NPEPL1H3BU86 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
STX16-NPEPL1H3BU86 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
STX16-NPEPL1H3BU86 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
STX16-NPEPL1H3BU86 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
STX16-NPEPL1H3BU86 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
STX16-NPEPL1H3BU86 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
STX16-NPEPL1H3BU86 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
STX16-NPEPL1H3BU86 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
STX16-NPEPL1H3BU86 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
STX16-NPEPL1H3BU86 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
STX16-NPEPL1H3BU86 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
STX16-NPEPL1H3BU86 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
STX16-NPEPL1H3BU86 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
STX16-NPEPL1H3BU86 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
STX16-NPEPL1H3BU86 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
STX16-NPEPL1H3BU86 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
STX16-NPEPL1H3BU86 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
STX16-NPEPL1H3BU86 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
STX16-NPEPL1H3BU86 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
STX16-NPEPL1H3BU86 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
STX16-NPEPL1H3BU86 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
STX16-NPEPL1H3BU86 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
STX16-NPEPL1H3BU86 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
STX16-NPEPL1H3BU86 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
STX16-NPEPL1H3BU86 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
STX16-NPEPL1H3BU86 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
STX16-NPEPL1H3BU86 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
STX16-NPEPL1H3BU86 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
STX16-NPEPL1H3BU86 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
STX16-NPEPL1H3BU86 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
STX16-NPEPL1H3BU86 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
STX16-NPEPL1H3BU86 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
STX16-NPEPL1H3BU86 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
STX16-NPEPL1H3BU86 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
STX16-NPEPL1H3BU86 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
STX16-NPEPL1H3BU86 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
STX16-NPEPL1H3BU86 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
STX16-NPEPL1H3BU86 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
STX16-NPEPL1H3BU86 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
STX16-NPEPL1H3BU86 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
STX16-NPEPL1H3BU86 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
STX16-NPEPL1H3BU86 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
STX16-NPEPL1H3BU86 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
STX16-NPEPL1H3BU86 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
STX16-NPEPL1H3BU86 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
STX16-NPEPL1H3BU86 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
STX16-NPEPL1H3BU86 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
STX16-NPEPL1H3BU86 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
STX16-NPEPL1H3BU86 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
STX16-NPEPL1H3BU86 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
STX16-NPEPL1H3BU86 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
STX16-NPEPL1H3BU86 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
STX16-NPEPL1H3BU86 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
STX16-NPEPL1H3BU86 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
STX16-NPEPL1H3BU86 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
STX16-NPEPL1H3BU86 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
STX16-NPEPL1H3BU86 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
STX16-NPEPL1H3BU86 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
STX16-NPEPL1H3BU86 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
STX16-NPEPL1H3BU86 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
STX16-NPEPL1H3BU86 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
STX16-NPEPL1H3BU86 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
STX16-NPEPL1H3BU86 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
STX16-NPEPL1H3BU86 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
STX16-NPEPL1H3BU86 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
STX16-NPEPL1H3BU86 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
STX16-NPEPL1H3BU86 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
STX16-NPEPL1H3BU86 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms