Protein–RNA interactions for Protein: F8W8V4

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8W8V4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
F8W8V4 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
F8W8V4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
F8W8V4 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
F8W8V4 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
F8W8V4 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
F8W8V4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
F8W8V4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
F8W8V4 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
F8W8V4 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
F8W8V4 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
F8W8V4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
F8W8V4 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
F8W8V4 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
F8W8V4 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
F8W8V4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
F8W8V4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
F8W8V4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
F8W8V4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
F8W8V4 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
F8W8V4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
F8W8V4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
F8W8V4 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
F8W8V4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
F8W8V4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
F8W8V4 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
F8W8V4 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
F8W8V4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
F8W8V4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
F8W8V4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
F8W8V4 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
F8W8V4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
F8W8V4 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
F8W8V4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
F8W8V4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
F8W8V4 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
F8W8V4 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
F8W8V4 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
F8W8V4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
F8W8V4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
F8W8V4 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
F8W8V4 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
F8W8V4 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
F8W8V4 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
F8W8V4 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
F8W8V4 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
F8W8V4 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
F8W8V4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
F8W8V4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
F8W8V4 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
F8W8V4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
F8W8V4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
F8W8V4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
F8W8V4 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
F8W8V4 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
F8W8V4 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
F8W8V4 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
F8W8V4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
F8W8V4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
F8W8V4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
F8W8V4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
F8W8V4 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
F8W8V4 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
F8W8V4 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
F8W8V4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
F8W8V4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
F8W8V4 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
F8W8V4 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
F8W8V4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
F8W8V4 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
F8W8V4 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
F8W8V4 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
F8W8V4 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
F8W8V4 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
F8W8V4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
F8W8V4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
F8W8V4 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
F8W8V4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
F8W8V4 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
F8W8V4 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
F8W8V4 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
F8W8V4 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
F8W8V4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
F8W8V4 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
F8W8V4 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
F8W8V4 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
F8W8V4 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
F8W8V4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
F8W8V4 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
F8W8V4 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
F8W8V4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
F8W8V4 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
F8W8V4 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
F8W8V4 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
F8W8V4 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
F8W8V4 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
F8W8V4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
F8W8V4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
F8W8V4 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
F8W8V4 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms