Protein–RNA interactions for Protein: E5RIL1

UPK3BL2, Uroplakin-3b-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK3BL2E5RIL1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UPK3BL2E5RIL1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UPK3BL2E5RIL1 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
UPK3BL2E5RIL1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UPK3BL2E5RIL1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UPK3BL2E5RIL1 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UPK3BL2E5RIL1 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UPK3BL2E5RIL1 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UPK3BL2E5RIL1 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
UPK3BL2E5RIL1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UPK3BL2E5RIL1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UPK3BL2E5RIL1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UPK3BL2E5RIL1 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UPK3BL2E5RIL1 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UPK3BL2E5RIL1 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UPK3BL2E5RIL1 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UPK3BL2E5RIL1 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UPK3BL2E5RIL1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UPK3BL2E5RIL1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UPK3BL2E5RIL1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UPK3BL2E5RIL1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UPK3BL2E5RIL1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UPK3BL2E5RIL1 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UPK3BL2E5RIL1 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UPK3BL2E5RIL1 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UPK3BL2E5RIL1 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UPK3BL2E5RIL1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UPK3BL2E5RIL1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UPK3BL2E5RIL1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UPK3BL2E5RIL1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UPK3BL2E5RIL1 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UPK3BL2E5RIL1 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UPK3BL2E5RIL1 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UPK3BL2E5RIL1 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UPK3BL2E5RIL1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UPK3BL2E5RIL1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UPK3BL2E5RIL1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
UPK3BL2E5RIL1 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
UPK3BL2E5RIL1 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
UPK3BL2E5RIL1 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
UPK3BL2E5RIL1 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
UPK3BL2E5RIL1 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
UPK3BL2E5RIL1 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
UPK3BL2E5RIL1 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
UPK3BL2E5RIL1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UPK3BL2E5RIL1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UPK3BL2E5RIL1 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UPK3BL2E5RIL1 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UPK3BL2E5RIL1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
UPK3BL2E5RIL1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UPK3BL2E5RIL1 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UPK3BL2E5RIL1 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UPK3BL2E5RIL1 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UPK3BL2E5RIL1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UPK3BL2E5RIL1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UPK3BL2E5RIL1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UPK3BL2E5RIL1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UPK3BL2E5RIL1 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
UPK3BL2E5RIL1 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UPK3BL2E5RIL1 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UPK3BL2E5RIL1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UPK3BL2E5RIL1 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UPK3BL2E5RIL1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UPK3BL2E5RIL1 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UPK3BL2E5RIL1 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
UPK3BL2E5RIL1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UPK3BL2E5RIL1 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UPK3BL2E5RIL1 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UPK3BL2E5RIL1 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UPK3BL2E5RIL1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UPK3BL2E5RIL1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UPK3BL2E5RIL1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UPK3BL2E5RIL1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UPK3BL2E5RIL1 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UPK3BL2E5RIL1 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UPK3BL2E5RIL1 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UPK3BL2E5RIL1 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
UPK3BL2E5RIL1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UPK3BL2E5RIL1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UPK3BL2E5RIL1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UPK3BL2E5RIL1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UPK3BL2E5RIL1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UPK3BL2E5RIL1 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UPK3BL2E5RIL1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UPK3BL2E5RIL1 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
UPK3BL2E5RIL1 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UPK3BL2E5RIL1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UPK3BL2E5RIL1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UPK3BL2E5RIL1 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UPK3BL2E5RIL1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UPK3BL2E5RIL1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UPK3BL2E5RIL1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UPK3BL2E5RIL1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UPK3BL2E5RIL1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UPK3BL2E5RIL1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UPK3BL2E5RIL1 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UPK3BL2E5RIL1 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UPK3BL2E5RIL1 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UPK3BL2E5RIL1 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UPK3BL2E5RIL1 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms