Protein–RNA interactions for Protein: C9J3I9

C5orf58, Putative uncharacterized protein C5orf58, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf58C9J3I9 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C5orf58C9J3I9 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
C5orf58C9J3I9 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C5orf58C9J3I9 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
C5orf58C9J3I9 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C5orf58C9J3I9 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C5orf58C9J3I9 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
C5orf58C9J3I9 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C5orf58C9J3I9 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C5orf58C9J3I9 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C5orf58C9J3I9 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C5orf58C9J3I9 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
C5orf58C9J3I9 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C5orf58C9J3I9 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
C5orf58C9J3I9 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
C5orf58C9J3I9 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C5orf58C9J3I9 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C5orf58C9J3I9 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C5orf58C9J3I9 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C5orf58C9J3I9 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C5orf58C9J3I9 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
C5orf58C9J3I9 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C5orf58C9J3I9 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C5orf58C9J3I9 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
C5orf58C9J3I9 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
C5orf58C9J3I9 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
C5orf58C9J3I9 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C5orf58C9J3I9 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C5orf58C9J3I9 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
C5orf58C9J3I9 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C5orf58C9J3I9 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C5orf58C9J3I9 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C5orf58C9J3I9 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C5orf58C9J3I9 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C5orf58C9J3I9 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
C5orf58C9J3I9 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C5orf58C9J3I9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C5orf58C9J3I9 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C5orf58C9J3I9 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C5orf58C9J3I9 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
C5orf58C9J3I9 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C5orf58C9J3I9 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
C5orf58C9J3I9 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
C5orf58C9J3I9 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C5orf58C9J3I9 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C5orf58C9J3I9 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C5orf58C9J3I9 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
C5orf58C9J3I9 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C5orf58C9J3I9 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
C5orf58C9J3I9 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
C5orf58C9J3I9 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C5orf58C9J3I9 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
C5orf58C9J3I9 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
C5orf58C9J3I9 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C5orf58C9J3I9 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C5orf58C9J3I9 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C5orf58C9J3I9 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
C5orf58C9J3I9 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C5orf58C9J3I9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
C5orf58C9J3I9 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
C5orf58C9J3I9 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
C5orf58C9J3I9 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C5orf58C9J3I9 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
C5orf58C9J3I9 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C5orf58C9J3I9 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C5orf58C9J3I9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C5orf58C9J3I9 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
C5orf58C9J3I9 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
C5orf58C9J3I9 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C5orf58C9J3I9 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C5orf58C9J3I9 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C5orf58C9J3I9 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
C5orf58C9J3I9 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C5orf58C9J3I9 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C5orf58C9J3I9 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C5orf58C9J3I9 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C5orf58C9J3I9 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C5orf58C9J3I9 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C5orf58C9J3I9 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C5orf58C9J3I9 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C5orf58C9J3I9 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C5orf58C9J3I9 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C5orf58C9J3I9 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C5orf58C9J3I9 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C5orf58C9J3I9 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C5orf58C9J3I9 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C5orf58C9J3I9 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C5orf58C9J3I9 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C5orf58C9J3I9 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
C5orf58C9J3I9 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
C5orf58C9J3I9 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
C5orf58C9J3I9 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
C5orf58C9J3I9 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
C5orf58C9J3I9 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
C5orf58C9J3I9 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
C5orf58C9J3I9 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
C5orf58C9J3I9 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
C5orf58C9J3I9 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C5orf58C9J3I9 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C5orf58C9J3I9 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms