Protein–RNA interactions for Protein: B0FP48

UPK3BL1, Uroplakin-3b-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK3BL1B0FP48 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UPK3BL1B0FP48 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UPK3BL1B0FP48 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
UPK3BL1B0FP48 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UPK3BL1B0FP48 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UPK3BL1B0FP48 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UPK3BL1B0FP48 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UPK3BL1B0FP48 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UPK3BL1B0FP48 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
UPK3BL1B0FP48 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UPK3BL1B0FP48 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UPK3BL1B0FP48 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UPK3BL1B0FP48 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UPK3BL1B0FP48 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UPK3BL1B0FP48 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UPK3BL1B0FP48 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UPK3BL1B0FP48 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UPK3BL1B0FP48 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UPK3BL1B0FP48 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UPK3BL1B0FP48 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UPK3BL1B0FP48 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UPK3BL1B0FP48 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UPK3BL1B0FP48 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UPK3BL1B0FP48 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UPK3BL1B0FP48 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UPK3BL1B0FP48 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UPK3BL1B0FP48 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UPK3BL1B0FP48 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UPK3BL1B0FP48 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UPK3BL1B0FP48 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UPK3BL1B0FP48 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UPK3BL1B0FP48 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UPK3BL1B0FP48 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UPK3BL1B0FP48 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UPK3BL1B0FP48 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UPK3BL1B0FP48 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UPK3BL1B0FP48 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
UPK3BL1B0FP48 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
UPK3BL1B0FP48 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
UPK3BL1B0FP48 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
UPK3BL1B0FP48 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
UPK3BL1B0FP48 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
UPK3BL1B0FP48 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
UPK3BL1B0FP48 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
UPK3BL1B0FP48 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UPK3BL1B0FP48 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UPK3BL1B0FP48 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UPK3BL1B0FP48 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UPK3BL1B0FP48 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
UPK3BL1B0FP48 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UPK3BL1B0FP48 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UPK3BL1B0FP48 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UPK3BL1B0FP48 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UPK3BL1B0FP48 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UPK3BL1B0FP48 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UPK3BL1B0FP48 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UPK3BL1B0FP48 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UPK3BL1B0FP48 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
UPK3BL1B0FP48 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UPK3BL1B0FP48 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UPK3BL1B0FP48 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UPK3BL1B0FP48 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UPK3BL1B0FP48 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UPK3BL1B0FP48 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UPK3BL1B0FP48 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
UPK3BL1B0FP48 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UPK3BL1B0FP48 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UPK3BL1B0FP48 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UPK3BL1B0FP48 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UPK3BL1B0FP48 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UPK3BL1B0FP48 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UPK3BL1B0FP48 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UPK3BL1B0FP48 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UPK3BL1B0FP48 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UPK3BL1B0FP48 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UPK3BL1B0FP48 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UPK3BL1B0FP48 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
UPK3BL1B0FP48 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UPK3BL1B0FP48 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UPK3BL1B0FP48 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UPK3BL1B0FP48 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UPK3BL1B0FP48 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UPK3BL1B0FP48 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UPK3BL1B0FP48 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UPK3BL1B0FP48 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
UPK3BL1B0FP48 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UPK3BL1B0FP48 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UPK3BL1B0FP48 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UPK3BL1B0FP48 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UPK3BL1B0FP48 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UPK3BL1B0FP48 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UPK3BL1B0FP48 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UPK3BL1B0FP48 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UPK3BL1B0FP48 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UPK3BL1B0FP48 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UPK3BL1B0FP48 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UPK3BL1B0FP48 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UPK3BL1B0FP48 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UPK3BL1B0FP48 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UPK3BL1B0FP48 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms