Protein–RNA interactions for Protein: A8K830

COLCA2, Colorectal cancer-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLCA2A8K830 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COLCA2A8K830 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
COLCA2A8K830 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COLCA2A8K830 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
COLCA2A8K830 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COLCA2A8K830 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COLCA2A8K830 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
COLCA2A8K830 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
COLCA2A8K830 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
COLCA2A8K830 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COLCA2A8K830 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
COLCA2A8K830 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
COLCA2A8K830 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
COLCA2A8K830 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COLCA2A8K830 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
COLCA2A8K830 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COLCA2A8K830 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COLCA2A8K830 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COLCA2A8K830 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COLCA2A8K830 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COLCA2A8K830 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COLCA2A8K830 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COLCA2A8K830 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COLCA2A8K830 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COLCA2A8K830 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COLCA2A8K830 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COLCA2A8K830 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COLCA2A8K830 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COLCA2A8K830 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COLCA2A8K830 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
COLCA2A8K830 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
COLCA2A8K830 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
COLCA2A8K830 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
COLCA2A8K830 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
COLCA2A8K830 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
COLCA2A8K830 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
COLCA2A8K830 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
COLCA2A8K830 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
COLCA2A8K830 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
COLCA2A8K830 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
COLCA2A8K830 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
COLCA2A8K830 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COLCA2A8K830 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COLCA2A8K830 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COLCA2A8K830 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COLCA2A8K830 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COLCA2A8K830 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COLCA2A8K830 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COLCA2A8K830 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COLCA2A8K830 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COLCA2A8K830 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COLCA2A8K830 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COLCA2A8K830 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
COLCA2A8K830 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COLCA2A8K830 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
COLCA2A8K830 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COLCA2A8K830 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COLCA2A8K830 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
COLCA2A8K830 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COLCA2A8K830 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COLCA2A8K830 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
COLCA2A8K830 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COLCA2A8K830 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
COLCA2A8K830 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
COLCA2A8K830 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COLCA2A8K830 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COLCA2A8K830 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COLCA2A8K830 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COLCA2A8K830 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COLCA2A8K830 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COLCA2A8K830 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COLCA2A8K830 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COLCA2A8K830 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COLCA2A8K830 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COLCA2A8K830 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COLCA2A8K830 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COLCA2A8K830 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COLCA2A8K830 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COLCA2A8K830 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COLCA2A8K830 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COLCA2A8K830 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COLCA2A8K830 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COLCA2A8K830 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COLCA2A8K830 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COLCA2A8K830 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COLCA2A8K830 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COLCA2A8K830 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COLCA2A8K830 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COLCA2A8K830 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COLCA2A8K830 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
COLCA2A8K830 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
COLCA2A8K830 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
COLCA2A8K830 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
COLCA2A8K830 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
COLCA2A8K830 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
COLCA2A8K830 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
COLCA2A8K830 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
COLCA2A8K830 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
COLCA2A8K830 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
COLCA2A8K830 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms