Protein–RNA interactions for Protein: A6NDN3

GOLGA6B, Golgin subfamily A member 6B, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6BA6NDN3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GOLGA6BA6NDN3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GOLGA6BA6NDN3 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GOLGA6BA6NDN3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GOLGA6BA6NDN3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
GOLGA6BA6NDN3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GOLGA6BA6NDN3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GOLGA6BA6NDN3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GOLGA6BA6NDN3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GOLGA6BA6NDN3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GOLGA6BA6NDN3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GOLGA6BA6NDN3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GOLGA6BA6NDN3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GOLGA6BA6NDN3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GOLGA6BA6NDN3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GOLGA6BA6NDN3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
GOLGA6BA6NDN3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GOLGA6BA6NDN3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GOLGA6BA6NDN3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GOLGA6BA6NDN3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GOLGA6BA6NDN3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GOLGA6BA6NDN3 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GOLGA6BA6NDN3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GOLGA6BA6NDN3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GOLGA6BA6NDN3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GOLGA6BA6NDN3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GOLGA6BA6NDN3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GOLGA6BA6NDN3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GOLGA6BA6NDN3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
GOLGA6BA6NDN3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GOLGA6BA6NDN3 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GOLGA6BA6NDN3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GOLGA6BA6NDN3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GOLGA6BA6NDN3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
GOLGA6BA6NDN3 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GOLGA6BA6NDN3 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GOLGA6BA6NDN3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GOLGA6BA6NDN3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GOLGA6BA6NDN3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GOLGA6BA6NDN3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GOLGA6BA6NDN3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GOLGA6BA6NDN3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GOLGA6BA6NDN3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GOLGA6BA6NDN3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GOLGA6BA6NDN3 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GOLGA6BA6NDN3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GOLGA6BA6NDN3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GOLGA6BA6NDN3 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GOLGA6BA6NDN3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
GOLGA6BA6NDN3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GOLGA6BA6NDN3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GOLGA6BA6NDN3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GOLGA6BA6NDN3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GOLGA6BA6NDN3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GOLGA6BA6NDN3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GOLGA6BA6NDN3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GOLGA6BA6NDN3 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GOLGA6BA6NDN3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
GOLGA6BA6NDN3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GOLGA6BA6NDN3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GOLGA6BA6NDN3 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GOLGA6BA6NDN3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GOLGA6BA6NDN3 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GOLGA6BA6NDN3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GOLGA6BA6NDN3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GOLGA6BA6NDN3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GOLGA6BA6NDN3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GOLGA6BA6NDN3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GOLGA6BA6NDN3 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GOLGA6BA6NDN3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GOLGA6BA6NDN3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GOLGA6BA6NDN3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GOLGA6BA6NDN3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GOLGA6BA6NDN3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GOLGA6BA6NDN3 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GOLGA6BA6NDN3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GOLGA6BA6NDN3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GOLGA6BA6NDN3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
GOLGA6BA6NDN3 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
GOLGA6BA6NDN3 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GOLGA6BA6NDN3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GOLGA6BA6NDN3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GOLGA6BA6NDN3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GOLGA6BA6NDN3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GOLGA6BA6NDN3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GOLGA6BA6NDN3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GOLGA6BA6NDN3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GOLGA6BA6NDN3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GOLGA6BA6NDN3 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GOLGA6BA6NDN3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GOLGA6BA6NDN3 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GOLGA6BA6NDN3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
GOLGA6BA6NDN3 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GOLGA6BA6NDN3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
GOLGA6BA6NDN3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GOLGA6BA6NDN3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GOLGA6BA6NDN3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GOLGA6BA6NDN3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
GOLGA6BA6NDN3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GOLGA6BA6NDN3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms