Protein–RNA interactions for Protein: A6NCW7

USP17L4, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L4A6NCW7 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
USP17L4A6NCW7 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
USP17L4A6NCW7 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
USP17L4A6NCW7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
USP17L4A6NCW7 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
USP17L4A6NCW7 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
USP17L4A6NCW7 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
USP17L4A6NCW7 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
USP17L4A6NCW7 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
USP17L4A6NCW7 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
USP17L4A6NCW7 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC28.27■■■□□ 2.12
USP17L4A6NCW7 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
USP17L4A6NCW7 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
USP17L4A6NCW7 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
USP17L4A6NCW7 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
USP17L4A6NCW7 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
USP17L4A6NCW7 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
USP17L4A6NCW7 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
USP17L4A6NCW7 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
USP17L4A6NCW7 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
USP17L4A6NCW7 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
USP17L4A6NCW7 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
USP17L4A6NCW7 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
USP17L4A6NCW7 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
USP17L4A6NCW7 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
USP17L4A6NCW7 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
USP17L4A6NCW7 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
USP17L4A6NCW7 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
USP17L4A6NCW7 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
USP17L4A6NCW7 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
USP17L4A6NCW7 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
USP17L4A6NCW7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
USP17L4A6NCW7 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
USP17L4A6NCW7 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
USP17L4A6NCW7 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
USP17L4A6NCW7 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
USP17L4A6NCW7 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
USP17L4A6NCW7 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
USP17L4A6NCW7 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
USP17L4A6NCW7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
USP17L4A6NCW7 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
USP17L4A6NCW7 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
USP17L4A6NCW7 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
USP17L4A6NCW7 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
USP17L4A6NCW7 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
USP17L4A6NCW7 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
USP17L4A6NCW7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
USP17L4A6NCW7 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
USP17L4A6NCW7 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
USP17L4A6NCW7 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
USP17L4A6NCW7 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
USP17L4A6NCW7 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
USP17L4A6NCW7 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
USP17L4A6NCW7 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
USP17L4A6NCW7 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
USP17L4A6NCW7 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
USP17L4A6NCW7 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
USP17L4A6NCW7 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
USP17L4A6NCW7 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
USP17L4A6NCW7 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
USP17L4A6NCW7 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
USP17L4A6NCW7 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
USP17L4A6NCW7 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
USP17L4A6NCW7 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
USP17L4A6NCW7 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
USP17L4A6NCW7 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
USP17L4A6NCW7 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
USP17L4A6NCW7 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
USP17L4A6NCW7 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
USP17L4A6NCW7 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
USP17L4A6NCW7 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
USP17L4A6NCW7 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
USP17L4A6NCW7 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
USP17L4A6NCW7 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
USP17L4A6NCW7 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
USP17L4A6NCW7 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
USP17L4A6NCW7 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
USP17L4A6NCW7 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
USP17L4A6NCW7 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
USP17L4A6NCW7 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
USP17L4A6NCW7 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
USP17L4A6NCW7 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
USP17L4A6NCW7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
USP17L4A6NCW7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
USP17L4A6NCW7 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
USP17L4A6NCW7 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
USP17L4A6NCW7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
USP17L4A6NCW7 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
USP17L4A6NCW7 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
USP17L4A6NCW7 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
USP17L4A6NCW7 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
USP17L4A6NCW7 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
USP17L4A6NCW7 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
USP17L4A6NCW7 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
USP17L4A6NCW7 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
USP17L4A6NCW7 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
USP17L4A6NCW7 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
USP17L4A6NCW7 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
USP17L4A6NCW7 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
USP17L4A6NCW7 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms