Protein–RNA interactions for Protein: A2A3K4

PTPDC1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPDC1A2A3K4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTPDC1A2A3K4 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTPDC1A2A3K4 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
PTPDC1A2A3K4 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTPDC1A2A3K4 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTPDC1A2A3K4 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTPDC1A2A3K4 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPDC1A2A3K4 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPDC1A2A3K4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPDC1A2A3K4 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPDC1A2A3K4 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPDC1A2A3K4 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTPDC1A2A3K4 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTPDC1A2A3K4 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTPDC1A2A3K4 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTPDC1A2A3K4 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTPDC1A2A3K4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTPDC1A2A3K4 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTPDC1A2A3K4 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTPDC1A2A3K4 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTPDC1A2A3K4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTPDC1A2A3K4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
PTPDC1A2A3K4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPDC1A2A3K4 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPDC1A2A3K4 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPDC1A2A3K4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPDC1A2A3K4 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPDC1A2A3K4 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPDC1A2A3K4 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPDC1A2A3K4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPDC1A2A3K4 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPDC1A2A3K4 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPDC1A2A3K4 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPDC1A2A3K4 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPDC1A2A3K4 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPDC1A2A3K4 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPDC1A2A3K4 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPDC1A2A3K4 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPDC1A2A3K4 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPDC1A2A3K4 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPDC1A2A3K4 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPDC1A2A3K4 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPDC1A2A3K4 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPDC1A2A3K4 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPDC1A2A3K4 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPDC1A2A3K4 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPDC1A2A3K4 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPDC1A2A3K4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPDC1A2A3K4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPDC1A2A3K4 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPDC1A2A3K4 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPDC1A2A3K4 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPDC1A2A3K4 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTPDC1A2A3K4 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
PTPDC1A2A3K4 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTPDC1A2A3K4 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTPDC1A2A3K4 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTPDC1A2A3K4 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTPDC1A2A3K4 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTPDC1A2A3K4 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTPDC1A2A3K4 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPDC1A2A3K4 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPDC1A2A3K4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPDC1A2A3K4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPDC1A2A3K4 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPDC1A2A3K4 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPDC1A2A3K4 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPDC1A2A3K4 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPDC1A2A3K4 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPDC1A2A3K4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPDC1A2A3K4 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPDC1A2A3K4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPDC1A2A3K4 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPDC1A2A3K4 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPDC1A2A3K4 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPDC1A2A3K4 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPDC1A2A3K4 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PTPDC1A2A3K4 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PTPDC1A2A3K4 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
PTPDC1A2A3K4 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PTPDC1A2A3K4 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PTPDC1A2A3K4 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPDC1A2A3K4 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPDC1A2A3K4 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPDC1A2A3K4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPDC1A2A3K4 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPDC1A2A3K4 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPDC1A2A3K4 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPDC1A2A3K4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPDC1A2A3K4 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPDC1A2A3K4 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPDC1A2A3K4 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPDC1A2A3K4 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTPDC1A2A3K4 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTPDC1A2A3K4 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTPDC1A2A3K4 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTPDC1A2A3K4 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
PTPDC1A2A3K4 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTPDC1A2A3K4 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTPDC1A2A3K4 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms