Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YWV2

TRBV4-1, T-cell receptor beta variable 4-1 (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV4-1A0A0J9YWV2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRBV4-1A0A0J9YWV2 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRBV4-1A0A0J9YWV2 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRBV4-1A0A0J9YWV2 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRBV4-1A0A0J9YWV2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRBV4-1A0A0J9YWV2 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TRBV4-1A0A0J9YWV2 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TRBV4-1A0A0J9YWV2 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRBV4-1A0A0J9YWV2 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TRBV4-1A0A0J9YWV2 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TRBV4-1A0A0J9YWV2 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRBV4-1A0A0J9YWV2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRBV4-1A0A0J9YWV2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TRBV4-1A0A0J9YWV2 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRBV4-1A0A0J9YWV2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TRBV4-1A0A0J9YWV2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRBV4-1A0A0J9YWV2 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRBV4-1A0A0J9YWV2 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRBV4-1A0A0J9YWV2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRBV4-1A0A0J9YWV2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRBV4-1A0A0J9YWV2 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TRBV4-1A0A0J9YWV2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRBV4-1A0A0J9YWV2 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TRBV4-1A0A0J9YWV2 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRBV4-1A0A0J9YWV2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TRBV4-1A0A0J9YWV2 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRBV4-1A0A0J9YWV2 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TRBV4-1A0A0J9YWV2 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRBV4-1A0A0J9YWV2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRBV4-1A0A0J9YWV2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRBV4-1A0A0J9YWV2 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
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TRBV4-1A0A0J9YWV2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
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TRBV4-1A0A0J9YWV2 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
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TRBV4-1A0A0J9YWV2 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRBV4-1A0A0J9YWV2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
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TRBV4-1A0A0J9YWV2 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
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TRBV4-1A0A0J9YWV2 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
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TRBV4-1A0A0J9YWV2 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
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TRBV4-1A0A0J9YWV2 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRBV4-1A0A0J9YWV2 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRBV4-1A0A0J9YWV2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
TRBV4-1A0A0J9YWV2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRBV4-1A0A0J9YWV2 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRBV4-1A0A0J9YWV2 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRBV4-1A0A0J9YWV2 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRBV4-1A0A0J9YWV2 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRBV4-1A0A0J9YWV2 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRBV4-1A0A0J9YWV2 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRBV4-1A0A0J9YWV2 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
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