Protein–RNA interactions for Protein: Q9P035

HACD3, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 3, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD3Q9P035 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HACD3Q9P035 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HACD3Q9P035 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HACD3Q9P035 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HACD3Q9P035 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HACD3Q9P035 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HACD3Q9P035 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HACD3Q9P035 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HACD3Q9P035 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HACD3Q9P035 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HACD3Q9P035 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HACD3Q9P035 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HACD3Q9P035 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HACD3Q9P035 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HACD3Q9P035 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HACD3Q9P035 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HACD3Q9P035 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HACD3Q9P035 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HACD3Q9P035 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HACD3Q9P035 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HACD3Q9P035 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HACD3Q9P035 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HACD3Q9P035 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HACD3Q9P035 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HACD3Q9P035 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HACD3Q9P035 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HACD3Q9P035 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HACD3Q9P035 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HACD3Q9P035 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HACD3Q9P035 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HACD3Q9P035 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HACD3Q9P035 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HACD3Q9P035 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HACD3Q9P035 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HACD3Q9P035 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HACD3Q9P035 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HACD3Q9P035 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HACD3Q9P035 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HACD3Q9P035 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HACD3Q9P035 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HACD3Q9P035 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HACD3Q9P035 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HACD3Q9P035 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HACD3Q9P035 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HACD3Q9P035 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HACD3Q9P035 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HACD3Q9P035 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HACD3Q9P035 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HACD3Q9P035 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HACD3Q9P035 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HACD3Q9P035 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HACD3Q9P035 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HACD3Q9P035 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HACD3Q9P035 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HACD3Q9P035 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HACD3Q9P035 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HACD3Q9P035 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HACD3Q9P035 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HACD3Q9P035 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HACD3Q9P035 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HACD3Q9P035 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HACD3Q9P035 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HACD3Q9P035 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HACD3Q9P035 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HACD3Q9P035 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HACD3Q9P035 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HACD3Q9P035 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HACD3Q9P035 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HACD3Q9P035 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HACD3Q9P035 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HACD3Q9P035 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HACD3Q9P035 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HACD3Q9P035 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HACD3Q9P035 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HACD3Q9P035 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HACD3Q9P035 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HACD3Q9P035 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HACD3Q9P035 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HACD3Q9P035 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HACD3Q9P035 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HACD3Q9P035 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HACD3Q9P035 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HACD3Q9P035 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HACD3Q9P035 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HACD3Q9P035 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HACD3Q9P035 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HACD3Q9P035 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HACD3Q9P035 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HACD3Q9P035 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HACD3Q9P035 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HACD3Q9P035 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HACD3Q9P035 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HACD3Q9P035 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HACD3Q9P035 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HACD3Q9P035 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HACD3Q9P035 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HACD3Q9P035 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HACD3Q9P035 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HACD3Q9P035 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HACD3Q9P035 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms