Protein–RNA interactions for Protein: Q969T4

UBE2E3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3Q969T4 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC14.97□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC14.97□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC14.97□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBE2E3Q969T4 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
UBE2E3Q969T4 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
UBE2E3Q969T4 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
UBE2E3Q969T4 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
UBE2E3Q969T4 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
UBE2E3Q969T4 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
UBE2E3Q969T4 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
UBE2E3Q969T4 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
UBE2E3Q969T4 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
UBE2E3Q969T4 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBE2E3Q969T4 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBE2E3Q969T4 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBE2E3Q969T4 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBE2E3Q969T4 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBE2E3Q969T4 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
UBE2E3Q969T4 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBE2E3Q969T4 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBE2E3Q969T4 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBE2E3Q969T4 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBE2E3Q969T4 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBE2E3Q969T4 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBE2E3Q969T4 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBE2E3Q969T4 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBE2E3Q969T4 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBE2E3Q969T4 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBE2E3Q969T4 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBE2E3Q969T4 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBE2E3Q969T4 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBE2E3Q969T4 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBE2E3Q969T4 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBE2E3Q969T4 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBE2E3Q969T4 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69 ms