Protein–RNA interactions for Protein: Q53EV4

LRRC23, Leucine-rich repeat-containing protein 23, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC23Q53EV4 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRRC23Q53EV4 GABPB1-201ENST00000220429 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRRC23Q53EV4 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRRC23Q53EV4 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRRC23Q53EV4 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRRC23Q53EV4 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRRC23Q53EV4 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRRC23Q53EV4 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRRC23Q53EV4 RGS12-202ENST00000338806 3010 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRRC23Q53EV4 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRRC23Q53EV4 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRRC23Q53EV4 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRRC23Q53EV4 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRRC23Q53EV4 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRRC23Q53EV4 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRRC23Q53EV4 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRRC23Q53EV4 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRRC23Q53EV4 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRRC23Q53EV4 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRC23Q53EV4 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRC23Q53EV4 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRC23Q53EV4 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRC23Q53EV4 SMARCA4-202ENST00000413806 5512 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRC23Q53EV4 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRC23Q53EV4 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRC23Q53EV4 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRC23Q53EV4 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRC23Q53EV4 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRC23Q53EV4 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRC23Q53EV4 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRC23Q53EV4 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRC23Q53EV4 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRC23Q53EV4 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRC23Q53EV4 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRC23Q53EV4 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRC23Q53EV4 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRC23Q53EV4 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRC23Q53EV4 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRC23Q53EV4 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRC23Q53EV4 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRC23Q53EV4 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRC23Q53EV4 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRC23Q53EV4 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRC23Q53EV4 DMAC1-201ENST00000358227 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRC23Q53EV4 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRC23Q53EV4 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRC23Q53EV4 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRC23Q53EV4 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRC23Q53EV4 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRC23Q53EV4 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRC23Q53EV4 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRC23Q53EV4 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRC23Q53EV4 SFI1-229ENST00000540643 4226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRC23Q53EV4 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRC23Q53EV4 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRC23Q53EV4 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRC23Q53EV4 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRC23Q53EV4 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRC23Q53EV4 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRC23Q53EV4 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LRRC23Q53EV4 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LRRC23Q53EV4 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LRRC23Q53EV4 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LRRC23Q53EV4 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LRRC23Q53EV4 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LRRC23Q53EV4 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LRRC23Q53EV4 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LRRC23Q53EV4 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
LRRC23Q53EV4 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LRRC23Q53EV4 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRRC23Q53EV4 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LRRC23Q53EV4 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LRRC23Q53EV4 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LRRC23Q53EV4 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LRRC23Q53EV4 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LRRC23Q53EV4 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LRRC23Q53EV4 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LRRC23Q53EV4 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LRRC23Q53EV4 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LRRC23Q53EV4 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LRRC23Q53EV4 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LRRC23Q53EV4 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRRC23Q53EV4 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LRRC23Q53EV4 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LRRC23Q53EV4 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRRC23Q53EV4 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRRC23Q53EV4 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRRC23Q53EV4 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRRC23Q53EV4 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LRRC23Q53EV4 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LRRC23Q53EV4 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRRC23Q53EV4 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRRC23Q53EV4 FUT1-201ENST00000310160 4246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LRRC23Q53EV4 PRRT2-201ENST00000300797 3002 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LRRC23Q53EV4 MKNK1-203ENST00000371945 2618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRRC23Q53EV4 PCDHA2-202ENST00000520672 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRRC23Q53EV4 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRRC23Q53EV4 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LRRC23Q53EV4 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LRRC23Q53EV4 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.4 ms