Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTXN3Q4LDR2 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
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