Protein–RNA interactions for Protein: Q499Y3

Putative uncharacterized protein C10orf88-like, humanhuman

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Length 187 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q499Y3 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q499Y3 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q499Y3 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q499Y3 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q499Y3 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q499Y3 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q499Y3 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q499Y3 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q499Y3 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q499Y3 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q499Y3 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q499Y3 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Q499Y3 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q499Y3 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q499Y3 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q499Y3 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q499Y3 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q499Y3 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q499Y3 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Q499Y3 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q499Y3 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q499Y3 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q499Y3 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q499Y3 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q499Y3 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q499Y3 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q499Y3 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q499Y3 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q499Y3 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q499Y3 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q499Y3 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q499Y3 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q499Y3 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q499Y3 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q499Y3 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q499Y3 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q499Y3 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q499Y3 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q499Y3 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q499Y3 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q499Y3 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q499Y3 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q499Y3 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q499Y3 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q499Y3 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Q499Y3 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Q499Y3 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Q499Y3 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q499Y3 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q499Y3 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q499Y3 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q499Y3 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q499Y3 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q499Y3 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q499Y3 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q499Y3 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q499Y3 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Q499Y3 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q499Y3 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q499Y3 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q499Y3 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q499Y3 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q499Y3 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q499Y3 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q499Y3 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q499Y3 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q499Y3 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q499Y3 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q499Y3 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Q499Y3 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q499Y3 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q499Y3 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q499Y3 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q499Y3 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q499Y3 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q499Y3 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q499Y3 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q499Y3 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q499Y3 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q499Y3 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q499Y3 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q499Y3 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q499Y3 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q499Y3 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q499Y3 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q499Y3 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q499Y3 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q499Y3 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q499Y3 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q499Y3 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q499Y3 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q499Y3 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q499Y3 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q499Y3 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q499Y3 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q499Y3 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q499Y3 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q499Y3 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q499Y3 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q499Y3 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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