Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SLC18A3Q16572 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC18A3Q16572 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC18A3Q16572 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC18A3Q16572 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC18A3Q16572 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC18A3Q16572 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC18A3Q16572 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC18A3Q16572 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC18A3Q16572 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC18A3Q16572 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC18A3Q16572 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC18A3Q16572 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC18A3Q16572 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC18A3Q16572 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC18A3Q16572 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC18A3Q16572 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC18A3Q16572 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC18A3Q16572 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC18A3Q16572 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC18A3Q16572 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC18A3Q16572 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC18A3Q16572 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC18A3Q16572 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC18A3Q16572 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC18A3Q16572 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC18A3Q16572 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC18A3Q16572 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC18A3Q16572 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC18A3Q16572 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC18A3Q16572 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC18A3Q16572 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC18A3Q16572 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC18A3Q16572 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC18A3Q16572 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC18A3Q16572 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC18A3Q16572 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC18A3Q16572 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC18A3Q16572 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC18A3Q16572 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC18A3Q16572 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC18A3Q16572 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC18A3Q16572 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC18A3Q16572 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC18A3Q16572 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC18A3Q16572 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC18A3Q16572 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC18A3Q16572 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC18A3Q16572 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC18A3Q16572 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC18A3Q16572 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC18A3Q16572 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC18A3Q16572 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC18A3Q16572 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC18A3Q16572 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC18A3Q16572 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC18A3Q16572 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC18A3Q16572 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC18A3Q16572 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC18A3Q16572 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC18A3Q16572 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC18A3Q16572 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC18A3Q16572 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC18A3Q16572 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC18A3Q16572 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC18A3Q16572 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC18A3Q16572 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC18A3Q16572 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC18A3Q16572 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC18A3Q16572 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC18A3Q16572 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC18A3Q16572 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC18A3Q16572 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC18A3Q16572 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC18A3Q16572 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC18A3Q16572 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC18A3Q16572 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC18A3Q16572 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC18A3Q16572 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC18A3Q16572 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC18A3Q16572 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC18A3Q16572 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC18A3Q16572 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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