Protein–RNA interactions for Protein: Q14019

COTL1, Coactosin-like protein, humanhuman

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Length 142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COTL1Q14019 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
COTL1Q14019 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
COTL1Q14019 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
COTL1Q14019 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
COTL1Q14019 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
COTL1Q14019 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
COTL1Q14019 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
COTL1Q14019 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
COTL1Q14019 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
COTL1Q14019 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
COTL1Q14019 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
COTL1Q14019 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
COTL1Q14019 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
COTL1Q14019 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
COTL1Q14019 MBP-205ENST00000397860 4844 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
COTL1Q14019 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
COTL1Q14019 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
COTL1Q14019 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.73□□□□□ -0.53
COTL1Q14019 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
COTL1Q14019 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
COTL1Q14019 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
COTL1Q14019 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
COTL1Q14019 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
COTL1Q14019 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
COTL1Q14019 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
COTL1Q14019 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
COTL1Q14019 PAQR3-209ENST00000512733 9811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
COTL1Q14019 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
COTL1Q14019 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
COTL1Q14019 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
COTL1Q14019 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
COTL1Q14019 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
COTL1Q14019 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
COTL1Q14019 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
COTL1Q14019 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
COTL1Q14019 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
COTL1Q14019 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
COTL1Q14019 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
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COTL1Q14019 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
COTL1Q14019 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
COTL1Q14019 AL031432.4-201ENST00000641729 2190 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
COTL1Q14019 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
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COTL1Q14019 SRRT-215ENST00000614484 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
COTL1Q14019 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
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COTL1Q14019 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
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COTL1Q14019 POTEE-201ENST00000356920 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
COTL1Q14019 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
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COTL1Q14019 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
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COTL1Q14019 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
COTL1Q14019 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
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COTL1Q14019 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
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COTL1Q14019 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
COTL1Q14019 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
COTL1Q14019 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
COTL1Q14019 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
COTL1Q14019 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
COTL1Q14019 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
COTL1Q14019 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
COTL1Q14019 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
COTL1Q14019 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
COTL1Q14019 RGL4-202ENST00000401461 2420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
COTL1Q14019 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
COTL1Q14019 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
COTL1Q14019 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
COTL1Q14019 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
COTL1Q14019 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
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