Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NME3Q13232 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NME3Q13232 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NME3Q13232 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
NME3Q13232 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NME3Q13232 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NME3Q13232 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NME3Q13232 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NME3Q13232 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NME3Q13232 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NME3Q13232 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NME3Q13232 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
NME3Q13232 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
NME3Q13232 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NME3Q13232 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NME3Q13232 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NME3Q13232 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NME3Q13232 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NME3Q13232 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NME3Q13232 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NME3Q13232 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NME3Q13232 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
NME3Q13232 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NME3Q13232 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NME3Q13232 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NME3Q13232 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NME3Q13232 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NME3Q13232 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NME3Q13232 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NME3Q13232 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NME3Q13232 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
NME3Q13232 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NME3Q13232 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NME3Q13232 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NME3Q13232 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NME3Q13232 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NME3Q13232 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NME3Q13232 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
NME3Q13232 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NME3Q13232 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NME3Q13232 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NME3Q13232 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NME3Q13232 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NME3Q13232 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NME3Q13232 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
NME3Q13232 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NME3Q13232 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NME3Q13232 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
NME3Q13232 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NME3Q13232 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NME3Q13232 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NME3Q13232 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NME3Q13232 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NME3Q13232 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NME3Q13232 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NME3Q13232 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NME3Q13232 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NME3Q13232 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NME3Q13232 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
NME3Q13232 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NME3Q13232 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NME3Q13232 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NME3Q13232 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NME3Q13232 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NME3Q13232 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NME3Q13232 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NME3Q13232 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NME3Q13232 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NME3Q13232 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NME3Q13232 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NME3Q13232 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NME3Q13232 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NME3Q13232 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NME3Q13232 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NME3Q13232 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NME3Q13232 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NME3Q13232 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NME3Q13232 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
NME3Q13232 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NME3Q13232 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NME3Q13232 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NME3Q13232 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
NME3Q13232 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NME3Q13232 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NME3Q13232 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
NME3Q13232 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NME3Q13232 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NME3Q13232 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NME3Q13232 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NME3Q13232 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NME3Q13232 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NME3Q13232 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NME3Q13232 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NME3Q13232 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NME3Q13232 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NME3Q13232 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NME3Q13232 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NME3Q13232 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NME3Q13232 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NME3Q13232 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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