Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMARCB1Q12824 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMARCB1Q12824 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
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