Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 PHF13-201ENST00000377648 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CD300CQ08708 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CD300CQ08708 PDZRN3-208ENST00000479530 2778 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CD300CQ08708 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CD300CQ08708 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CD300CQ08708 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CD300CQ08708 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CD300CQ08708 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CD300CQ08708 ACADM-201ENST00000370834 2172 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CD300CQ08708 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CD300CQ08708 MYO1G-201ENST00000258787 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CD300CQ08708 PER1-202ENST00000354903 3115 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CD300CQ08708 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CD300CQ08708 ENO2-205ENST00000535366 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CD300CQ08708 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CD300CQ08708 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CD300CQ08708 RNF220-203ENST00000361799 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CD300CQ08708 RNF220-204ENST00000372247 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CD300CQ08708 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CD300CQ08708 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CD300CQ08708 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CD300CQ08708 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
CD300CQ08708 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CD300CQ08708 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CD300CQ08708 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CD300CQ08708 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CD300CQ08708 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CD300CQ08708 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CD300CQ08708 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CD300CQ08708 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CD300CQ08708 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CD300CQ08708 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CD300CQ08708 PIM2-201ENST00000376509 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CD300CQ08708 RBM15-203ENST00000602849 3368 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CD300CQ08708 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CD300CQ08708 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CD300CQ08708 SUPV3L1-201ENST00000359655 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CD300CQ08708 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CD300CQ08708 TMEM41A-203ENST00000421852 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CD300CQ08708 PTPN5-205ENST00000477854 2826 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CD300CQ08708 SLC5A4-201ENST00000266086 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CD300CQ08708 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CD300CQ08708 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CD300CQ08708 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CD300CQ08708 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
CD300CQ08708 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
CD300CQ08708 AP000437.1-201ENST00000624057 2085 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
CD300CQ08708 PRPF4-201ENST00000374198 2787 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
CD300CQ08708 OTUD4-201ENST00000447906 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
CD300CQ08708 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 TEX35-204ENST00000367642 2452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 MKL1-201ENST00000355630 4496 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 TRMT61A-202ENST00000389749 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 FRMD1-205ENST00000440994 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
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CD300CQ08708 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 TMEM233-201ENST00000426426 3081 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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CD300CQ08708 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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CD300CQ08708 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
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CD300CQ08708 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 KY-202ENST00000503669 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 ARHGEF2-201ENST00000313667 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 LEPROTL1-201ENST00000321250 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 UNK-205ENST00000589666 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 CPN2-201ENST00000323830 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 CARS-AS1-201ENST00000499962 2664 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 HERC6-202ENST00000273960 3473 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 PBXIP1-203ENST00000368465 3144 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 SLC37A4-202ENST00000357590 2356 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CD300CQ08708 MAN2C1-242ENST00000569482 3177 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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