Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CYP4F3Q08477 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CYP4F3Q08477 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms