Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CACNB2Q08289 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms