Protein–RNA interactions for Protein: P32297

CHRNA3, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA3P32297 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNA3P32297 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNA3P32297 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNA3P32297 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNA3P32297 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNA3P32297 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNA3P32297 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNA3P32297 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNA3P32297 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNA3P32297 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNA3P32297 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNA3P32297 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNA3P32297 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNA3P32297 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNA3P32297 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNA3P32297 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNA3P32297 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNA3P32297 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNA3P32297 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNA3P32297 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNA3P32297 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNA3P32297 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNA3P32297 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNA3P32297 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNA3P32297 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNA3P32297 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNA3P32297 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNA3P32297 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNA3P32297 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNA3P32297 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNA3P32297 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNA3P32297 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNA3P32297 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNA3P32297 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNA3P32297 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNA3P32297 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNA3P32297 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA3P32297 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA3P32297 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA3P32297 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA3P32297 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA3P32297 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA3P32297 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA3P32297 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA3P32297 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA3P32297 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA3P32297 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA3P32297 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA3P32297 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA3P32297 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA3P32297 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA3P32297 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA3P32297 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA3P32297 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA3P32297 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA3P32297 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA3P32297 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA3P32297 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA3P32297 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA3P32297 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA3P32297 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA3P32297 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA3P32297 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA3P32297 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA3P32297 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA3P32297 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA3P32297 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA3P32297 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA3P32297 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA3P32297 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA3P32297 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA3P32297 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA3P32297 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA3P32297 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA3P32297 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA3P32297 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA3P32297 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA3P32297 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA3P32297 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA3P32297 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA3P32297 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA3P32297 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA3P32297 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA3P32297 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA3P32297 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA3P32297 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA3P32297 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA3P32297 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA3P32297 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA3P32297 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNA3P32297 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNA3P32297 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNA3P32297 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNA3P32297 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNA3P32297 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNA3P32297 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNA3P32297 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNA3P32297 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNA3P32297 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNA3P32297 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms