Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRMP28827 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRMP28827 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRMP28827 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRMP28827 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRMP28827 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRMP28827 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRMP28827 CTSV-201ENST00000259470 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRMP28827 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRMP28827 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRMP28827 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRMP28827 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRMP28827 GDPGP1-201ENST00000329600 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRMP28827 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRMP28827 ROPN1B-203ENST00000505382 713 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRMP28827 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRMP28827 PMEL-214ENST00000550447 901 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRMP28827 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRMP28827 AL353622.2-201ENST00000605846 425 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRMP28827 IQSEC2-207ENST00000638583 722 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRMP28827 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRMP28827 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRMP28827 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRMP28827 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRMP28827 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRMP28827 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRMP28827 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRMP28827 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRMP28827 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRMP28827 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRMP28827 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRMP28827 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRMP28827 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRMP28827 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRMP28827 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRMP28827 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRMP28827 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRMP28827 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRMP28827 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRMP28827 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRMP28827 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRMP28827 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRMP28827 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRMP28827 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRMP28827 COX8A-201ENST00000314133 507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRMP28827 HIST1H2BJ-201ENST00000339812 381 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRMP28827 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRMP28827 MANEA-202ENST00000369293 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRMP28827 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRMP28827 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRMP28827 HNRNPA1P42-201ENST00000458678 957 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRMP28827 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRMP28827 EVX1-AS-203ENST00000519218 554 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRMP28827 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRMP28827 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRMP28827 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRMP28827 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRMP28827 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRMP28827 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRMP28827 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRMP28827 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRMP28827 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRMP28827 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRMP28827 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRMP28827 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRMP28827 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRMP28827 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRMP28827 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRMP28827 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRMP28827 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRMP28827 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRMP28827 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRMP28827 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRMP28827 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRMP28827 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRMP28827 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRMP28827 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRMP28827 SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 1479 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRMP28827 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRMP28827 JAZF1-AS1-201ENST00000436758 548 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRMP28827 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRMP28827 RPS5-204ENST00000598098 536 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRMP28827 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRMP28827 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRMP28827 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRMP28827 STAG1-206ENST00000480733 1304 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRMP28827 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRMP28827 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRMP28827 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRMP28827 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRMP28827 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRMP28827 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRMP28827 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRMP28827 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRMP28827 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRMP28827 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRMP28827 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRMP28827 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRMP28827 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRMP28827 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
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