Protein–RNA interactions for Protein: P24385

CCND1, G1/S-specific cyclin-D1, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCND1P24385 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCND1P24385 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CCND1P24385 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCND1P24385 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCND1P24385 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCND1P24385 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCND1P24385 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCND1P24385 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCND1P24385 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCND1P24385 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCND1P24385 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCND1P24385 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCND1P24385 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCND1P24385 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCND1P24385 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCND1P24385 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCND1P24385 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCND1P24385 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCND1P24385 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCND1P24385 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCND1P24385 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCND1P24385 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCND1P24385 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCND1P24385 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCND1P24385 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCND1P24385 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCND1P24385 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCND1P24385 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCND1P24385 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCND1P24385 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCND1P24385 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCND1P24385 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCND1P24385 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCND1P24385 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCND1P24385 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCND1P24385 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCND1P24385 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCND1P24385 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCND1P24385 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCND1P24385 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCND1P24385 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCND1P24385 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCND1P24385 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCND1P24385 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCND1P24385 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCND1P24385 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCND1P24385 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCND1P24385 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCND1P24385 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCND1P24385 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCND1P24385 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCND1P24385 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCND1P24385 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCND1P24385 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCND1P24385 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCND1P24385 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCND1P24385 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCND1P24385 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCND1P24385 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCND1P24385 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCND1P24385 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCND1P24385 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCND1P24385 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCND1P24385 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCND1P24385 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCND1P24385 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCND1P24385 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCND1P24385 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCND1P24385 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCND1P24385 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCND1P24385 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCND1P24385 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCND1P24385 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCND1P24385 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCND1P24385 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCND1P24385 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCND1P24385 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCND1P24385 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCND1P24385 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCND1P24385 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCND1P24385 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCND1P24385 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCND1P24385 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCND1P24385 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCND1P24385 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCND1P24385 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCND1P24385 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCND1P24385 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCND1P24385 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCND1P24385 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCND1P24385 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CCND1P24385 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCND1P24385 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCND1P24385 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCND1P24385 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCND1P24385 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCND1P24385 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CCND1P24385 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCND1P24385 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCND1P24385 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms