Protein–RNA interactions for Protein: P17947

SPI1, Transcription factor PU.1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPI1P17947 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPI1P17947 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPI1P17947 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPI1P17947 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPI1P17947 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPI1P17947 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPI1P17947 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPI1P17947 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPI1P17947 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPI1P17947 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
SPI1P17947 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPI1P17947 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPI1P17947 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPI1P17947 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPI1P17947 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPI1P17947 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPI1P17947 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SPI1P17947 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SPI1P17947 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SPI1P17947 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SPI1P17947 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SPI1P17947 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SPI1P17947 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SPI1P17947 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SPI1P17947 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SPI1P17947 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SPI1P17947 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SPI1P17947 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SPI1P17947 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SPI1P17947 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SPI1P17947 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SPI1P17947 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SPI1P17947 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
SPI1P17947 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SPI1P17947 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SPI1P17947 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SPI1P17947 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SPI1P17947 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SPI1P17947 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SPI1P17947 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SPI1P17947 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SPI1P17947 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SPI1P17947 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SPI1P17947 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SPI1P17947 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SPI1P17947 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SPI1P17947 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SPI1P17947 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SPI1P17947 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SPI1P17947 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
SPI1P17947 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
SPI1P17947 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SPI1P17947 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SPI1P17947 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SPI1P17947 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
SPI1P17947 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SPI1P17947 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SPI1P17947 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SPI1P17947 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
SPI1P17947 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
SPI1P17947 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
SPI1P17947 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SPI1P17947 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SPI1P17947 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SPI1P17947 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SPI1P17947 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SPI1P17947 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
SPI1P17947 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SPI1P17947 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SPI1P17947 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SPI1P17947 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SPI1P17947 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SPI1P17947 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SPI1P17947 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SPI1P17947 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SPI1P17947 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SPI1P17947 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SPI1P17947 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SPI1P17947 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SPI1P17947 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SPI1P17947 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SPI1P17947 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SPI1P17947 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SPI1P17947 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SPI1P17947 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SPI1P17947 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SPI1P17947 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SPI1P17947 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SPI1P17947 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SPI1P17947 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SPI1P17947 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SPI1P17947 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SPI1P17947 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SPI1P17947 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SPI1P17947 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SPI1P17947 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SPI1P17947 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SPI1P17947 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SPI1P17947 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
SPI1P17947 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
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